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文件名称: AFPhyloMix-源码
  所属分类: 其它
  开发工具:
  文件大小: 553kb
  下载次数: 0
  上传时间: 2021-03-31
  提 供 者: weixin_********
 详细说明:AFPhyloMix:混合物的免组装系统发生学 AFPhyloMix是一种从短读序列中恢复单倍型系统发育的方法,该短读序列是使用合并的扩增子从个体混合物中获得的,而无需条形码。 AFPhyloMix接受读取序列与参考序列的比对,沿比对获得单核苷酸多态性(SNP)模式,并根据SNP模式构建系统进化树。 AFPhyloMix采用贝叶斯推断模型来估计单倍型的系统发育及其相对频率,前提是已知单倍型的数量。 安装 该软件是用C ++编写的,并且已经在Linux和MacOS平台上进行了测试。 您需要在计算机中安装C ++编译器才能编译源代码。 编译步骤如下所示(xxx是AFPhyloMix的版本): $ tar -zxvf AFPhyloMix-xxx.tar.gz $ cd AFPhyloMix-xxx $ make 然后将显示一个可执行文件:AFPhyloMix。 句法 从SAM / BAM
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)

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