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Circall:Circall是一种从配对末端RNA测序数据中发现环状RNA的新颖方法-源码
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上传时间: 2021-03-31
详细说明:Circall版本0.0.0的文档
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最新消息
2020年5月30日:版本0.0.0
首次提交
1.简介
Circall是一种从配对末端RNA测序数据中发现环状RNA的新颖方法。 Circall的特点是采用准映射进行快速准确的比对,并采用多维局部错误发现方法进行circRNA候选评估,从而提高了circRNA检测的准确性。 方法出版物中描述了该方法的全部详细信息。
软件要求:
Circall用R和C ++实现。 我们承认来自Sailfish,Rapmap和该软件中使用的其他工具的材料。
GCC的C ++-11兼容编译器版本(g ++> = 4.8.2)
R软件包版本3.6.0或更高版本,并带有以下已安装的软件包:GenomicFeatures,Biostrings,f
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