文件名称:
scito:在Jupyter笔记本电脑中进行SCITO-seq分析的PythonC packade-源码
开发工具:
文件大小: 65kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-31
详细说明：SCITO-seq：单细胞组合索引细胞术测序
打包以部署在无服务器Lambda上。 潜在的集装箱化。
无服务器计数管道的结构（SCITO计数）
用户在进行任何处理之前将数据上传到S3。
用户创建一个配置文件并将其推送到S3。
Lambda 1：接收S3事件。 将FASTQ文件拆分为1Gb的块。 创建SQS队列并在那里发送字节范围。 创建Lambda 2 。 在S3中创建一个进程名称为0字节的复合触发器文件。 复合触发器应为12个字节以触发Lambda 3 。
Lambda 2：并发Lambda。 SQS触发字节范围的下载并创建可充气BGZF块的“内容表”。 监控SQS深度。 如果没有消息，则SQS被销毁并调用Lambda 3 。
Lambda 3：销毁Lambda 2的所有实例。 为样本的每个读取文件提取描述FASTQ文件的BGZF块的内容表。 合并它们并进行重复数据删除。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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