文件名称:
CoMS_fastq_to_bins:从读取中创建垃圾箱-源码
开发工具:
文件大小: 5kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-30
详细说明：CoMS_fastq_to_bins
从读取中创建垃圾箱
从Fastq到Bins
数据
专门针对所有5个样本的“高复杂度” fastq文件。
阅读质量控制
测序运行返回的读数并不完美，因此通常需要进行一些纠正，以使错误不会从测序读数传播到其他数据产物。
bbtools用于读取质量控制和常规格式
JGI提供了一组脚本，这些脚本可以处理您希望在名为bbtools 读取文件上执行的许多不同任务。 读取QC通常是通过和两个工具执行的。 两种工具都可以工作，并且可以相当快地处理您的读取，但是bbduk可以工作得更快，所以这就是我们今天要使用的东西。
通过conda进行安装（其他选项可通过上面的链接获得）。 这里使用版本38.51，但现在也提供更新的版本。
conda create --name=bbmap-38.51
conda activate bbmap-38.51
conda insta
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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