文件名称:
Eimeria_Soay:Eimeria spp的元条形码。 在苏伊羊-源码
开发工具:
文件大小: 20mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-30
详细说明：Eimeria_Soay
Eimeria spp的元条形码。 在苏伊羊
18S引物（核基因组）
我们首先测试18S引物是否与所有Soay Eimeria物种的18S in Aligments结合（完全无错配）。 我们从NCBI的序列中获得比对。
然后，我们测试它们扩增的序列是否通过在扩增序列中具有至少一个核苷酸差异来区分Soay Eimeria物种。 我们列出了至少具有一个差异的每种引物。
COI引物（线粒体基因组）
我们比对来自NCBI的序列（只有一种Soay Eimeria物种和其他反刍动物的亲缘种）。
我没有进行自动设计（因为差异很大），因此基于alignemt“ COI_aln.fasta”手动设计了引物。 我在一个格式“COI_Soay_primerMan.txt”这些引存储“ ”（使用网站上的未对齐的fasta文件“COI_clean.fasta”）。 另请参见“
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