开发工具:
文件大小: 6mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-30
详细说明:CRISPRme
CRISPRme是一个基于Web的工具,致力于通过用户友好的GUI和在VCF日期集中搜索单个变体的精确范围,对CRISPR / Cas实验进行预测分析和结果评估。
考虑到这一目标,我们创建了一个简单的程序包,从下载必要的数据到执行完整的搜索,并执行任何步骤,并将包含图像和列表式目标的详尽结果报告呈现给用户,以使用包含的基于Web的内容进行导航GUI。
该软件由两个主要功能组成:
完全搜索,用于从头开始输入数据(例如参考基因组,一组VCF数据和sgRNA目标列表)开始执行搜索的功能。
靶标整合,用于将结果靶标与gencode邻近文件进行整合,以识别靶标附近的基因,并仅收集CFD得分最高的得分靶标。
Web界面,用于启动可从Web浏览器本地访问的Web界面的功能
CRISPRme的安装和使用
使用CRISPRitz的两种最快方法是通过安装Docker或Conda。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
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