文件名称:
NCI-DOE-Collab-Pilot1-Gene_Expression_Autoencoder-源码
开发工具:
文件大小: 238kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-30
详细说明:NCI-DOE-Collab-Pilot1-Gene_Expression_Autoencoder
描述:
基因表达自动编码器功能(试点1基准1,也称为P1B1)显示了如何构建稀疏自动编码器,该稀疏自动编码器可以将高维表达谱压缩为低维向量。
用户社区:
研究人员对以下主题感兴趣:
初级:癌症生物学数据建模
中学:机器学习; 生物信息学; 计算生物学
可用性:
当前代码大量使用了CANDLE API。 可由在python和领域中经验丰富的数据科学家使用。
唯一性:
自动编码器不是降低尺寸的唯一方法。 其他技术,例如主成分分析,t分布随机邻居嵌入(tSNE)和均匀流形逼近和投影(UMAP),对于分子数据也很受欢迎。 对于高维输入向量,自动编码器可能是有益的,但这需要进行研究。
成分:
未经训练的模型:
未训练的神经网络模型在定义。
数据:
在处理了训练和测试数据。
训练有素
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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