文件名称:
modPhred:modPhred是用于从原始ONT数据中检测DNARNA修饰的管道-源码
开发工具:
文件大小: 30mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-26
详细说明：modPhred
modPhred是用于检测，注释和可视化来自原始ONT数据的DNA / RNA修饰的管道。 管道包括四个步骤/模块：
管道包括四个步骤/模块（）：
1. modEncode ：编码FastQ中的修改概率（mod_encode.py）
2. modAlign ：在BAM中建立路线keepind修改信息（mod_align.py）
3. modReport提取RNA修饰信息（bedGraph）和QC报告（mod_report.py）
4. modAnalysis ：绘制维恩图（mod_plot.py），共存修改（mod_correlation.py）和基于修改概要文件的基于读取的聚类（mod_cluster.py）
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引文
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