文件名称:
nf-core-umi_preprocessing-源码
开发工具:
文件大小: 92kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-22
详细说明:一个开放源代码管道,用于准备umi fastqs进行变体检测。
介绍
nf-core / umipreprocessing是一种生物信息学最佳实践分析管道,用于为umi fastqs的变体调用准备bam文件
该管道是使用构建的, 是一种工作流工具,可以以非常便携的方式跨多个计算基础架构运行任务。它带有docker容器,使安装变得简单,结果可高度重现。
快速开始
安装
安装 , 或任何一个以实现完整的管道重现性(请仅将作为最后的手段;请参阅 )
下载管道并使用单个命令在最小数据集上对其进行测试:
nextflow run nf-core/umipreprocessing -profile test, < docker>
请检查以查看研究所是否已存在运行nf-core管道的自定义配置文件。如果是这样,您只需在命令中使用-
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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