开发工具:
文件大小: 11mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明：普拉斯卡德
Plascad是一种计算有效的工具，专为自动质粒分类，ARG注释和质粒可视化而设计。
内容
Plascad工作流程Plascad首先在查询质粒序列中预测ORF，然后通过hmmsearch使用已建立的HMM蛋白图谱检测与质粒转移相关的基因的同源物。然后，它通过搜索结构化的ARGs数据库（SARG）来识别ARG，最后，将使用AngularJS的质粒可视化组件集成到该管道中，以可视化分类的共轭质粒。
要求
Linux， ， ， ， ，
安装
Plascad可以通过conda或pip进行安装，尽管我们建议使用Conda。
1， Conda
使用或安装Plascad
conda create -n Plascad -y -c bioconda -c pianpianyouche plascad
conda activate Plascad
2， pip3
如果您在P
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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