文件名称:
motif-mark-oop:卡带外显子图案可视化，面向对象-源码
开发工具:
文件大小: 20kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-21
详细说明：图案标记oop
motif_mark_oop.py脚本可将来自fasta文件的基因片段上的基序可视化。包含Fasta标头，外显子，基序和一般基因组的类。
概括
在被翻译成蛋白质之前，mRNA经历了剪接过程，以去除内含子并将外显子粘贴在一起。通常，mRNA可以被剪接，产生可能对某种细胞类型或功能具有特异性的同工型。选择性剪接可通过某些基序或短序列的存在来介导，其中调节剪接的蛋白结合或定位。该脚本的目的是快速可视化基因片段和基序的位置。
输入
包含内含子为小写而外显子为大写的基因的fasta文件
txt文件，每行包含一个主题，支持IUPAC歧义编码，不区分大小写
输出
SVG文件以fasta文件的前缀命名
黑色细线代表的内含子
外显子是黑色矩形
图案是彩色的并由图例表示
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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