文件名称:
DENR:使用PRO-seq选择最活跃的转录成绩单模型-源码
开发工具:
文件大小: 489kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：标题
作者
丹尼尔
诺亚·杜克勒（Noah Dukler）
借助转录本水平分辨率对新生RNA测序数据进行定量
安装
DENR包
可以使用以下代码行安装软件包：
devtools::install_github("CshlSiepelLab/DENR")
Tensorflow和Keras
该TSS的识别方法使用深层学习框架Keras和Tensorflow 。仅支持tensorflow 2.0或更高版本。请注意，R tensorflow软件包的版本tensorflow在tensorflow使用的python版本不同。要检查它是否运行。
tensorflow::tf_config()
从R安装tensorflow和keras的说明可以在找到。
概述
DENR对新生的RNA测序数据进行基于注释的转录水平定量。尽管它是基于PRO-seq数据开发的，但通常应适用于任何经过处理的新生测序数据集，
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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