文件名称:
eDNA_spatial_temporal_variation:Taylor Ely，Paul H. Barber和Zachary Gold撰写的“调查近岸岩石礁环境中eDNA的时空变化”中的代码，数据集和图形-源码
开发工具:
文件大小: 8mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-19
详细说明：eDNA_spatial_temporal_variation
Taylor Ely，Paul H. Barber和Zachary Gold针对“调查近岸岩石礁环境中eDNA的时空变化”的分析生成的代码，数据集和图形。去污代码由Zack Gold编写，也可以在他的页面上找到
去污：
使用修改后的gruinard_decon脚本进行净化处理，以处理2个单独的测序项目的存在。在整个净化过程中，两个项目都包括了阴性和阳性对照以及所有样品。然后，MPA项目的数据输出是单独的净化后处理。
输入输入位于数据目录中
原始Anacapa输出-fishcard_12S_all_ASV_raw_taxonomy_60_edited.txt此文件是标准的Anacapa输出社区站点表，其中包含示例列和ASV行。请参阅上面链接的Anacapa Github页面，以获取有关生物信息学处理的更详细说明。
元数据文件-
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