开发工具:
文件大小: 69kb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-18
详细说明：体细胞短V
按照，该存储库中的脚本从BAM文件中调用了体细胞短变体（SNP和indel）。已对工作流和脚本进行了专门优化，以在Gadi国家计算基础架构上高效且大规模地运行。
设置
GRCh38 / hg38 + ALT重叠群
Somatic-ShortV管道与管道无缝。脚本使用相对路径，因此正确的设置很重要。
完成后：
转到创建最终bams的工作目录。
确保您有一个.config文件，该文件是制表符分隔的文件，其中包含#SampleID LabSampleID SeqCentre Library(default=1) （与使用的配置相同或完全相同#SampleID LabSampleID SeqCentre Library(default=1) ）。将为.config中包含的示例创建示例GVCF和多示例VCF。样品ID必须以-B或-N结尾（这表示它们是正常的，而不是肿瘤
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
相关说明
- 本站资源为会员上传分享交流与学习,如有侵犯您的权益,请联系我们删除.
- 本站是交换下载平台，提供交流渠道，下载内容来自于网络，除下载问题外，其它问题请自行百度。
- 本站已设置防盗链，请勿用迅雷、QQ旋风等多线程下载软件下载资源，下载后用WinRAR最新版进行解压.
- 如果您发现内容无法下载，请稍后再次尝试；或者到消费记录里找到下载记录反馈给我们.
- 下载后发现下载的内容跟说明不相乎，请到消费记录里找到下载记录反馈给我们，经确认后退回积分.
- 如下载前有疑问，可以通过点击"提供者"的名字，查看对方的联系方式，联系对方咨询.
