文件名称:
cbpManager:生成,管理和编辑适合导入cBioPortal for Cancer Genomics的数据和元数据文件-源码
开发工具:
文件大小: 3mb
下载次数: 0
上传时间: 2021-03-17
详细说明:抽象的
多维癌症基因组学数据集的直观可视化和交互式探索对于癌症基因组学领域至关重要。 癌症基因组学的cBioPortal是一种开放获取,开放源代码的工具,可以将不同类型的改变与临床数据集成在一起。 “ cBioPortal的目标是通过快速,直观,高质量地访问大规模癌症基因组计划的分子概况和临床属性,从而显着降低复杂基因组数据与癌症研究人员之间的障碍,并因此赋予研究人员翻译的能力这些丰富的数据集将有助于生物学研究和临床应用。” (有关癌症基因组学的cBioPortal的更多信息,请。)cBioPortal允许安装自己的实例以分析您自己的数据。 用于上传到自己实例的数据必须具有某些文件格式。 尽管详细记录了这些规范,但是创建此类特定文件对于医疗专业人员或技术经验不足的人员而言并不容易,并且通常非常耗时。
R包cbpManager提供了一个R Shiny应用程序,该应用程序有助于生成适合导入
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
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