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搜索资源列表

  1. decoding the massive loblolly pine genome

  2. 有关松树基因组测序分析的文章，欢迎大家下载哦。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2015-02-03
    • 文件大小：1mb
    • 提供者：swuhq

  1. aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz

  2. 用于极速下载aspera支持的资源，生物信息用于NCBI，EBI基因组下载

  3. 所属分类：Linux

    • 发布日期：2018-05-09
    • 文件大小：33mb
    • 提供者：u011262253

  1. 武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析

  2. 武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析 这是一份中英都有的文档，包含了武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析，大家要下载下来看看。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-04-30
    • 文件大小：80kb
    • 提供者：m11229

  1. 功能基因组学ppt

  2. 功能基因组学，来源于网络，有需要的可以下载。

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2015-07-15
    • 文件大小：2mb
    • 提供者：qq_27776265

  1. 宏基因组 metagenome_知识图谱.xmind

  2. 本图谱根据《肠道菌群与妊娠期糖尿病相关性的研究进展》一文进行整理，主要有宏基因组的介绍、肠道菌群分类、功能以及应用层面介绍了关于如何通过检测发现肠道菌群与糖尿病、妊娠糖尿病以及肥胖和免疫之间的关系。不过对于庞大的宏基因组而言只此也仅为冰山一角，因此后续将不断迭代更新。欢迎下载及提意见。

  3. 所属分类：医疗

    • 发布日期：2020-11-26
    • 文件大小：204kb
    • 提供者：devshilei

  1. 人类参考基因组

  2. 人类参考基因组 一、人类参考基因组的来源 1、人类基因组计划 1）2001年草图，绘制人类基因组图谱 2、数据库的名称 1）UCSC：hg19，hg38 2）NCBI：GRCH19，GRCH38 二、如何下载参考基因组 在 linux 中下载参考序列数据库： 1. hg38：wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg38.fa.gz 2. hg19：wget http://hgdownload.cse.ucsc.e

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-12-21
    • 文件大小：85kb
    • 提供者：weixin_38553837

  1. 宏基因组注释和可视化神器MEGAN入门

  2. 文章目录MEGAN-宏基因组功能和物种分类MEGAN功能简介原理简要示意图MEGAN特有文件格式：RMAMEGAN下载MEGAN使用MEGAN（linux版本安装）MEGAN使用指南（Linux）提取注释内容（物种和功能）：提取物种注释数据：提取功能：Win版安装和使用MEGAN安装Win版使用指南MEGAN主界面介绍MEGAN输入介绍MEGAN分析进阶双样本比对MEGAN界面可视化-两样本（.rma）比对物种信息可视化功能信息可视化数据导出MEGAN多个样本分析方案猜你喜欢写在后面 有时间可以

  3. 所属分类：其它

  1. 基因组文库的构建

  2. 美食该如何制作？食品安全以什么为标准？用什么来检测食品成分？这么一份基因组文库的构建来为你解开心中...该文档为基因组文库的构建，是一份很不错的参考资料，具有较高参考价值，感兴趣的可以下载看看

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-02
    • 文件大小：286kb
    • 提供者：weixin_38677505

  1. TE_finder:开发了一套C ++程序，用于转座子搜索及其在大型真核生物基因组序列中的注释。 REPET包装的一部分-源码

  2. TE Finder 2.29 概述 TE Finder套件收集了为可转座子搜索及其在大型真核基因组序列中的注释而开发的C ++程序。但是我们认为这些工具足够通用，可以在其他情况下使用。 该套件主要由四个程序BLASTER，MATCHER，GROUPER和DUSTER组成。可以通过MATCHER和GROUPER程序进一步处理BLASTER的结果，但是如果将它们的输出正确格式化为a，则可以将这最后两个程序与其他程序（例如RepeatMasker，CENSOR，BLAST，BLAT等）结合使用。 BL

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-19
    • 文件大小：731kb
    • 提供者：weixin_42165490

  1. NextPolish:快速准确地抛光长时间读取产生的基因组-源码

  2. 下一个波兰语 NextPolish用于修复由嘈杂的长时间读取产生的基因组中的基本错误（SNV / Indel），它可用于仅短读数据或仅长读数据或两者结合使用。 它包含两个核心模块，并采用逐步方式来校正参考基因组中的错误碱基。 要更正/组装原始的第三代测序（TGS）长读，并产生约10-15％的测序错误，请使用 。 安装 下载单击或使用以下命令： wget https://github.com/Nextomics/NextPolish/releases/download/v1.3.1/NextPol

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：168kb
    • 提供者：weixin_42109639

  1. sequence-finder:在细菌基因组中搜索物种特定区域-源码

  2. 序列查找器 小型快速Python管道，用于搜索细菌基因组中特定于物种的区域。 要求 您需要安装： 高炉- conda install -c bioconda blast 安装 克隆回购 git clone gitgithub.com:polinchen98/sequence-finder.git 安装套件 pip intall -r requirements.txt 如果这在旧版本的Python上失败，请尝试首先更新您的pip工具： pip install --upgrade pip 用

  3. 所属分类：其它

  1. VirMC:从宏基因组样本中预测病毒序列-源码

  2. 虚拟计算机 从宏基因组样本中预测病毒序列 VirMC：用于从宏基因组样品或组装的宏基因组重叠群中预测病毒序列的软件包 版本：1.1 作者：宋凯 维护者：Kai Song 描述 该软件包提供了一些功能，可以计算成对的读取和组装的重叠群的k元组的出现次数。 基于马尔可夫模型计算读段或重叠群属于病毒基因组的可能性。 因此，该软件包提供了以下功能 （1）计算每个重叠群和读取的k元组的出现次数； （2）计算每个重叠群的可能性，并基于马尔可夫模型进行读取。 依存关系 VirMC执行需要pytho

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-09
    • 文件大小：84mb
    • 提供者：weixin_42175035

  1. vg：用于处理基因组变异图的工具-源码

  2. vg 变异图数据结构，互换格式，对齐方式，基因分型和变异调用方法 变异图提供了许多基因组序列的简洁编码。 变异图（特别是在vg中实现）由以下部分组成： 节点，由序列和ID标记 边缘，通过两个端点的任意一端连接两个节点 路径，描述通过边缘连接的节点时的基因组，序列比对和注释（例如基因模型和转录本） 该模型类似于已在装配和多序列比对中使用的序列图。 路径提供了相对于图中编码的基因组的坐标系，即使更改了图的结构，也可以生成稳定的映射。 变异图模型使这种嵌入变得明确而必不可少。 vg中的工具在图

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：24mb
    • 提供者：weixin_42109732

  1. RegAssembler：RegAssembler是采用强大的回归和重新采样技术的基因组组装程序-源码

  2. 曹圣浩＆李雷敏版权所有:copyright:2021。 中国科学院数学与系统科学研究院，北京100190 RegAssembler 1.简介 RegAssembler是采用稳健的回归和重新采样技术的基因组组装器。 当前版本是专为使用Illumina测序读数高信度重建SARS-CoV-2基因组而设计的。 2.安装 您可以通过以下命令下载软件包： git clone https://github.com/csh3/RegAssembler.git 然后在RegAssembler目录中运行管道。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：23kb
    • 提供者：weixin_42127783

  1. r-acidgenomes：用于下载和处理基因组注释的工具包-源码

  2. 酸性基因组 用于下载和处理基因组注释的工具包。 安装 法 install.packages( pkgs = " AcidGenomes " , repos = c( " https://r.acidgenomics.com " , getOption( " repos " ) ) )

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：157kb
    • 提供者：weixin_42149153

  1. hmftools：用于分析基因组数据的各种算法-源码

  2. HMF工具 该存储库包含各种用于分析基因组测序数据的算法 HMF算法使用的资源可以从下载 可从下面的链接中获得以下算法的更详细描述： 致谢 Hartwig Medical Foundation使用YourKit Java Profiler进行性能调整。 YourKit支持具有创新和智能工具的开源项目，用于监视和分析Java和.NET应用程序。 YourKit是 ， 和的创建者。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：58mb
    • 提供者：weixin_42127775

  1. SARS-CoV2-variant-calling-example：一个具有教育意义的示例，该示例使用SARS-CoV2基因组，使用带有短读Illumina数据的调用变体-源码

  2. SARS-CoV2变量调用示例 该存储库包含用于对SARS-CoV2数据执行示例变体调用分析的代码和指令。 分析中使用的所有数据均可公开获得。 步骤1 下载并安装 第2步 克隆此存储库： git clone https://github.com/davidecarlson/SARS-CoV2-variant-calling-example.git 第三步 使用提供的环境文件，使用此分析中所需的软件创建新的conda环境： conda env create -f environment.ya

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-08
    • 文件大小：47kb
    • 提供者：weixin_42141437

  1. 越狱：我们越狱您的病历和基因组数据。 免费-源码

  2. 我们越狱了电子病历（EMR）以帮助解决 。 根据联邦法律，您有权获得健康记录。 该项目使您能够做的是贡献您的匿名数据，以帮助发现最佳治疗途径。 参加战斗。 支持的提供商 这个怎么运作 当前的过程非常简单，将来会变得更加复杂，尤其是考虑到多组学的时候。 输入医疗服务提供者别名（请参见下表）和门户网站凭据。 运行jailbreak.sh脚本。 确保已安装 。 该程序然后执行： 登录到提供商的门户。 浏览并下载 （医疗）记录。 将记录解析为JSON格式，以匿名化过程中的数据。 将

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-31
    • 文件大小：281kb
    • 提供者：weixin_42170064

  1. 难题：BEDOPS：高性能基因组特征操作-源码

  2. BEDOPS v2.4.39：高性能基因组特征操作 关于 BEDOPS v2.4.39是一套用于解决基因组研究中提出的常见问题的工具，主要涉及数据集之间的重叠和邻近关系。 它旨在具有可扩展性和灵活性，以促进高效，准确地分析和管理大规模基因组数据。 BEDOPS v2.4.39文档的部分概述了工具包，功能和性能增强。 表提供了所有应用程序和脚本的文档。 资料下载 Linux Mac OS X 源代码 二进制文件 Linux主机的 安装程序包 Mac OS X主机的 （tar.gz） （zi

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-30
    • 文件大小：21mb
    • 提供者：weixin_42144199

  1. 云管道：云不可知基因组分析，科学计算和存储平台-源码

  2. 云管道 Cloud Pipeline解决方案将AWS ， GCP和Azure计算和存储资源包装到一个服务中。 提供一种简单且可扩展的方法来完成各种科学任务。 数据处理：创建数据处理管道并以自动化方式在云中运行它们。 每个管道代表带有版本化的源代码，文档和配置的工作流脚本。 您可以在Cloud Pipeline环境中创建此类脚本，也可以从本地计算机上载它们。 数据存储管理：直接在Cloud Pipeline用户界面中创建数据存储，下载或上传数据或编辑文件。 支持文件版本控制。 工具管理：使

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-01-28
    • 文件大小：24mb
    • 提供者：weixin_42139460
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