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搜索资源列表

  1. DNAstar使用说明

  2. DNASTAR 的lasergene序列分析软件 简介 Lasergene由8个应用程序组成，每个程序都组织成功能单元。整个Lasergene系统包括一下一些软件： SeqManII：整理（trim）和组装（assemble）序列数据，以及确定共有序列。 GeneQuset：在小的、与BAC相当大小的或较大的序列中发现并标注基因、图谱（pattern）以及其他特征。 Protean：预测蛋白质二级结构，鉴定抗原（antigen）区。 MegAlign：以配对形式（pairwise）或多重比对形

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2010-06-25
    • 文件大小：1mb
    • 提供者：qdddddd

  1. DNA序列拼接的研究

  2. 文章主要研究了第三代基因组装技术的算法及其实现方法

  3. 所属分类：教育

    • 发布日期：2014-06-26
    • 文件大小：24mb
    • 提供者：qq_16659537

  1. 软件设计规范

  2. 范围：CPU上可以识别的代码和数据。全部的代码总和。 要求：从定义开始的设计。完整性，彻底地定义从无开始的整个设计。这是因为软件之软，也是因为硬件平台的多样性和特殊性。 完整把握，从头设计是第一原则。因为软件世界自己并不能统一，还有继续分化的趋势。没有根本一致的基础可能是软件的本性。退回到一无所有是处理软件问题的根本。 在这样的视野下，操作系统只是一个部分，一个模块，不同的操作系统任你选择；语言的选择是运行环境的选择（每种语言有每种语言的运行时布局）；所谓框架只是“类库＋运行环境”的一种构造。

  3. 所属分类：Java

    • 发布日期：2015-03-11
    • 文件大小：57kb
    • 提供者：l240473169

  1. mega画系统发育树

  2. 16S基因片段组装，在NCBI中进行Blast比对，利用下载的序列在mega绘制进化树，多组图片作为详解！

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-05-17
    • 文件大小：15mb
    • 提供者：vivianzzc

  1. ExploreSparkforMetagenomeassembly.pdf

  2. 在SPARK SUMMIT 2017上，Zhong Wang, Ph.D. Group Lead, DOE Joint Genome Institute Lawrence Berkeley National Lab分享了题为《Explore Spark for Metagenome assembly》，就宏基因组测序技术，宏基因组装，解决大数据：Apache Spark等方面的内容做了深入的分析。

  3. 所属分类：其它

  1. Fibroblast activity on multilayer laminin5 beta3 DNA coating titanium surface

  2. 钛表面laminin5 beta3基因涂层对成纤维细胞活动的影响，江巧红，赵士芳，这项工作是研究在钛片表面组装阳离子脂质体和pEGFP-C1-LAMB3多层基因薄层及该涂层对NIH3T3细胞的影响。这种基因涂层通过层层静电自组装�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-25
    • 文件大小：699kb
    • 提供者：weixin_38708223

  1. 家蚕HSP10基因的表达、纯化及抗体制备

  2. 家蚕HSP10基因的表达、纯化及抗体制备，梁飞，程晨，HSP10是一种小分子热休克蛋白，在蛋白质的正确折叠、组装及防止热诱导的蛋白质聚集等方面发挥重要功能。本研究采用RT-PCR法从家蚕卵�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-12
    • 文件大小：380kb
    • 提供者：weixin_38723236

  1. Riboswitch DNA体外组装及相应文库构建

  2. Riboswitch DNA体外组装及相应文库构建，侯文华，朱聪，Riboswitch是一类非编码的RNA，通过自身与小分子配体（如维生素，核苷酸等）的结合在转录与翻译阶段调节相应的基因表达。其中与小分�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-06
    • 文件大小：464kb
    • 提供者：weixin_38514805

  1. 聚赖氨酸和纳米金-碳纳米管杂合体层层组装DNA电化学生物传感器及PAT基因序列的灵敏检测

  2. 聚赖氨酸和纳米金-碳纳米管杂合体层层组装DNA电化学生物传感器及PAT基因序列的灵敏检测，杜萌，焦奎，本章制备了一种新的DNA电化学生物传感器。在带负电的巯基丙酸修饰的金电极表面吸附上带正电的阳离子聚合物聚赖氨酸（pLys），并利�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-30
    • 文件大小：354kb
    • 提供者：weixin_38660918

  1. 体外合成组装多元核糖开关

  2. 体外合成组装多元核糖开关，黄艳，朱聪，生物芯片为人工合成基因提供了一个相对简便的方法，传统的按序合成目的基因或基因组序列的方法既费时又不经济，且合成的目标序列

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-04
    • 文件大小：475kb
    • 提供者：weixin_38612568

  1. dragonstar2019-源码

  2. 龙之星2019 该GitHub存储库包含演讲幻灯片以及2019年Dragon Star生物信息学课程的计算练习。 这是一个为期五天的课程，主题为“人类疾病的基因组学”。 课程内容如下： 第一天 疾病研究中的基因组技术：， NGS数据格式和变式调用：， 第二天 短/长读序列数据的比对：， 通过短读/长读测序进行基因组组装：， 第三天 人类疾病中结构变异的检测：， 基因变异的注释和表型驱动的解释：， 第四天 SNP和基于序列的全基因组关联研究（GWAS）：， 稀有变种和从头变种关联研究：， 生

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-15
    • 文件大小：41mb
    • 提供者：weixin_42126865

  1. phage-cycle-源码

  2. 活体噬菌体循环项目 该项目使用Bigraph运算来模拟溶菌和溶菌周期的玩具模型。 这需要噬菌体附着，基因插入，基因整合，基因表达，基因复制，细胞分裂，噬菌体组装和裂解。 安装 说明用户如何启动和运行。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-13
    • 文件大小：75kb
    • 提供者：weixin_42175035

  1. e15-4yp-Optimizing-chloroplast-genome-assembly-and-annotation-with-skim-sequencing-data:叶绿体基因和基因组是用于植物系统发育和物种鉴定的最重要的基因组数

  2. 请参考以下网址中的说明：

  3. 所属分类：其它

  1. MetagenomeProcessing：测序后对元基因组进行组装，注释和分类的管道-源码

  2. 处理元基因组测序读 测序过程后用于宏基因组读取的组装，注释和分类分类的管道。 指数 质量控制使用fastqc ，适配器调整使用cutadapt 。 使用MEGAHIT组装读数。 使用PROKKA进行基因预测和注释。 使用DIAMOND和eggNOG数据库的附加功能注释。 宏基因组读段的分类学分类。 初始文件 基本上，我们将从测序过程产生的最终读取文件开始。 我们将假设来自配对分析的每个元基因组都有两个文件： R1.fastq.gz R2.fastq.gz 依存关系 FastQC v0

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-03
    • 文件大小：12kb
    • 提供者：weixin_42107374

  1. AppliedGenomics2021：2021年Spring应用基因组学课程材料-源码

  2. JHU EN.601.749：计算基因组学：应用比较基因组学 教授： （mschatz cs.jhu.edu） TA： （arun.das jhu.edu） 上课时间：星期一+星期三 1：30p-2：45p（缩放）（有关链接，请参见） 沙茨办公时间：预约办公时间：星期一12-1pm，需要预约 本课程的主要目标是使学生具有理论基础，并让该课程有权进行独立的基因组分析。 我们将研究从原始测序数据开始的用于比较和分析基因组的领先计算和定量方法。 该课程将侧重于人类基因组学和人类医学应用，但是这

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：76mb
    • 提供者：weixin_42159267

  1. 2021年沉沉，提交了《整体环境科学》修订版-源码

  2. Shen等人，2021年。《整体环境科学》。 修订稿提交了暴露于生菜的生菜-土壤系统中的细菌群落组装和抗生素抗性基因 附件中，您将找到以下文件： 输入数据表（细菌群落，ARG，抗生素浓度） R markdown（.rmd）文件-细菌社区 R markdown（.rmd）文件-抗生素抗性基因 Qiime2 16S rRNA扩增子测序批处理（.batch） 原始序列文件（.fastq）可根据要求提供

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：119kb
    • 提供者：weixin_42133452

  1. synbio：用于进行合成生物学的简单python软件包-源码

  2. synbio：用于进行合成生物学的简单python软件包 这是用于合成生物学的自制包装。 它提供了表示生物学通用原语的Python类。 文献资料 还没有。 给我电子邮件（ ）如果您有疑问 依存关系 需要 。 好吧，仅当您想进行自动基因组装时。 所有的核心代码都是用纯Python编写的。 将来的重构会将代码库分为纯Python和依赖于外部模块的软件包。 安装 运行以下命令 git clone https://github.com/jecalles/synbio.git pip install

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：49kb
    • 提供者：weixin_42160278

  1. waafle：WAAFLE（注释装配和查找LGT事件的工作流程）是一种用于在装配的基因组中寻找新型LGT（横向基因转移）事件的方法，包括来自人类微生物组的基因组-源码

  2. 华夫 WAAFLE（A，带orkflow至A nnotate甲ssemblies和F IND大号GT事件）是用于查找新的LGT（横向基因转移）在组装宏基因组，包括那些来自人微生物组事件的方法。 WAAFLE是由Tiffany Hsu和Eric A. Franzosa在哈佛大学Chan Chan公共卫生学院的开发的。 请将问题直接发送到的。 引文 蒂芙尼·许（Tiffany Y.Hsu），埃里克·弗朗索萨（Eric A. 人类微生物组中新型横向基因转移事件的概况。 （准备中） （虽然WAAFLE

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：22mb
    • 提供者：weixin_42110038

  1. pachyseris:电子笔记本，用于“形态停滞掩盖热带珊瑚礁上生态上截然不同的珊瑚物种”-源码

  2. “形态停滞掩盖了热带暗礁上生态上不同的珊瑚物种” 预印本参考： Bongaerts P，Cooke I，Ying H，Wels D，Haan den S，Hernandez-Agreda，Brunner C，Dove S，Englebert N，Eyal G，ForêtS，Grinblat M，Hay KB，Harii S，Hayward DC， Lin Y，MihaljevićM，Moya A，Muir P，Sinniger F，Smallhorn-West P，Torda G，Ragan

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-30
    • 文件大小：18mb
    • 提供者：weixin_42157567

  1. 基因组组装算法：调查

  2. 基因突变技术在过去的二十几年里取得了突飞猛进的发展，通过以高通量，短读取，特定为特征的新一代基因突变技术的问世，只有一个物种全基因的时间和成本大大降低。基于逐步降低的技术的全基因组装算法和软件相继开发出来，目前比较成熟的基因组装算法大约有二十种左右。由于基因组装问题本身的复杂性，目前还没有针对不同组装算法的根据此简要概述了现有的十二种具有已知的基因组装算法，系统的分析了另一种算法的设计步骤，算法原理，操作环境。以及研究。关于如何设计基因组装算法，对于不同的基因数据如何选择更合适的基因组装算法和软

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-28
    • 文件大小：252kb
    • 提供者：weixin_38710578
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