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搜索资源列表

  1. Unix编程艺术

  2. 本书主要介绍了Unix系统领域中的设计和开发哲学、思想文化体系、原则与经验，由公认的Unix编程大师、开源运动领袖人物之一Eric S. Raymond倾力多年写作而成。包括Unix设计者在内的多位领域专家也为本书贡献了宝贵的内容。本书内容涉及社群文化、软件开发设计与实现，覆盖面广、内容深邃，完全展现了作者极其深厚的经验积累和领域智慧。 序 xxv Part I 1 第1章 哲学 3 1.1 文化？什么文化 3 1.2 Unix的生命力 4 1.3 反对学习Unix文化的理由 5 1.4 Un

  3. 所属分类：Unix

    • 发布日期：2015-01-02
    • 文件大小：28mb
    • 提供者：zengzhenxig

  1. IOI国家集训队论文集1999-2019

  2. # 国家集训队论文列表（1999-2019） ___点击目录快速跳转：___ - _国家集训队论文列表（1999-2019）_ * [_1999_](#1999) * [_2000_](#2000) * [_2001_](#2001) * [_2002_](#2002) * [_2003_](#2003) * [_2004_](#2004) * [_2005_](#2005) * [_2006_](#2006) * [_2007_](#2007) * [_2008_](#2008) * [_2

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2019-09-20
    • 文件大小：105mb
    • 提供者：jiazhendong

  1. bbsubset-源码

  2. bbsubset 这是用来干嘛的 ？ bbsubset是R的简单工具，它可以从整个集合中选择每个子组件足够远的DNA条形码子集。 安装 您可以使用以下命令安装bbsubset ： devtools :: install_github( " tfwis/bbsubset " ) 用法 输入 需要在向量类中输入完整的DNA条形码，向量的一个元素是一个条形码。 教程 加载包裹 在尝试此示例之前，请确认已安装这些软件包。 library( ROI ) library( slam ) 创建由DNAB

  3. 所属分类：其它

  1. epidecodeR-源码

  2. EpidecodeR epidecodeR，一种R包，能够整合从大量表观基因组学或表观转录组学技术（例如ChIP-seq，ATAC-seq，m6A-seq等）产生的DNA / RNA表观遗传数据，以及以差异基因表达的形式失调的基因列表，核糖体占有率或蛋白质差异翻译，并识别由于与基因相关的不同程度的DNA / RNA化学修饰而导致基因失调的影响。 epidecodeR生成累积分布函数（CDF）图，该图显示了基于与基因相关的修饰程度将基因分为几组之间的总体log2FC趋势的变化。 该工具还测试基因

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-17
    • 文件大小：659kb
    • 提供者：weixin_42157166

  1. miRDriver:用于推断癌症中拷贝数衍生的miRNA基因网络的计算工具-源码

  2. miRDriver R包miRDriver使用GISTIC识别频繁畸变的区域，并计算两个患者组之间的差异表达基因，即频繁畸变组和非频繁畸变组。 利用拷贝数畸变，DNA甲基化，基因表达，转录因子表达和miRNA表达数据集，miRDriver应用了基于LASSO的方法来选择miRNA与靶标基因的相互作用。 我们对来自癌症基因组图谱（TCGA）数据库的乳腺癌和卵巢癌数据进行了miRDriver测试。 请遵循R文件夹中的源代码。 miRDriver正在建设中，将作为Bioconductor R软件

  3. 所属分类：其它

  1. scripts:等效的wordpressscripts更简单-最小且可配置的Webpack设置-源码

  2. 剧本 :dna: 关于脚本 这是一组脚本，这些脚本对（不仅是）WordPress开发有用。 受到启发，此程序包包含具有默认配置的基本工具。 :floppy_disk: 安装 您只需要安装一个模块： npm install micropackage/scr ipts --save-dev 或者 yarn add -D micropackage/scr ipts :joystick: 用法 该软件包公开了一个名为mp-scr ipts的二进制mp-scr ipts ，可以直接使用npx或y

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-10
    • 文件大小：293kb
    • 提供者：weixin_42109732

  1. drep:DNARNA序列的动态表示-源码

  2. drep DNA / RNA序列的动态表示 R库，用于通过DNA / RNA序列的动态表示来表征生物序列。 有关技术细节，请阅读下面提到的文章之一。 DNA / RNA序列的二维动态表示作为寨卡病毒基因组的表征工具，MATCH Communications在数学和计算机化学中77（2）：321-332 生物序列的动态表示，MATCH通信在数学和计算机化学中的应用82（1）：205-218 为了安装软件包，请在R控制台中运行以下代码： 库（devtools） install_githu

  3. 所属分类：其它

  1. Bindables：:dna:Android DataBinding套件，用于通知MVVM架构上从Model层到UI层的数据更改-源码

  2. 可绑定的 :dna: Android DataBinding工具包，用于通知数据从模型层到UI层的更改。 该库提供了DataBinding的基类（BindingActivity，BindingFragment，BindingViewModel）， 并支持在没有可观察字段和LiveData的情况下通知数据更改的方式。 用例 您可以在以下存储库中引用此库的良好用例。 - :dagger: Android Pokedex使用基于MVVM架构的Hilt，Motion，Coroutines，Flow

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-04
    • 文件大小：201kb
    • 提供者：weixin_42129797

  1. ChimeraX：分子图形程序UCSF ChimeraX的源代码-源码

  2. UCSF ChimeraX分子可视化 是一种用于可视化和分析分子结构（例如蛋白质，RNA，DNA，脂质以及基因序列），电子显微镜图，X射线图，3D光学显微镜和3D医学成像扫描的应用程序。 它是计划的后继者。 和显示了其一些功能，显示了示例命令和Python API的用法。 平台类 ChimeraX可在Windows，macOS和Linux上运行，并且免费供学术和政府使用（）。 商业用途需要支持软件开发的。 它大约是80％的Python 3代码和20％的C ++代码。 C ++用于速度至关重要的部

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：47mb
    • 提供者：weixin_42121272

  1. SingleMoleculeFootprinting：用于SMF数据分析的R包-源码

  2. 单分子印迹 介绍 SingleMoleculeFootprinting是围绕构建的R软件包，专门用于分析单分子足迹（SMF）数据。 SMF是在开发的一种高通量测序技术。 它包括使用外源甲基转移酶在GpC和CpG环境中标记可及的基因组胞嘧啶，以及随后进行的亚硫酸氢盐测序（BS）。 因此，受DNA相互作用蛋白（例如TF，核小体，GTF等）结合保护的胞嘧啶将被甲基化，而可及的胞嘧啶将被甲基化。 使用本程序包，我们提供了从对齐的bam文件到单个站点结果的生物学解释，执行基本SMF数据分析的功能。 前

  3. 所属分类：其它

  1. na-源码

  2. 关于rnnXna rnnXna是用于训练递归神经网络（RNN）的工具，用于对DNA和RNA序列数据集进行分类和回归模型。 工具支持训练和掠夺模式，可以使用经过训练的模型来推断关于新输入日期集的新预测。 安装与设定 rnnXna可以使用Anaconda软件包管理器（Conda）安装，而无需解决任何依赖性问题。 如果安装了anaconda或miniconda程序包管理器，只需运行以下命令以安装rnnXna及其依赖项。 conda install -c gabaldonlab rnnxna

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：68mb
    • 提供者：weixin_42112685

  1. 剧本-源码

  2. Jordbear的脚本 概述 该存储库包含为各种目的而开发的许多脚本。 用于分析DNA测序数据 编写了许多Bash脚本，以使用免费和开源的生物信息学工具自动执行DNA测序数据的处理。 所使用的工具包括但不限于：Trimmomatic，Bowtie2，HISAT2，Samtools，Picard和Bedtools。 在适当的情况下，需要安装这些工具才能成功运行脚本。 强烈建议将包含使用脚本的目录添加到PATH变量，以便Bash终端可以轻松调用它们。 编写了许多Python脚本来整理和绘制来自处

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：167kb
    • 提供者：weixin_42116604

  1. kfw-backend：kfwx:gear::dna:的后端Flask应用程序-源码

  2. kfw后端 这是用于MacOS X和Windows的工具包，可自动分析数据以进行分析。 了解输出 本节详细说明数据分析结果的重要性。 膜电位 元数据表-该表包含有关实验本身的信息 ID-实验ID。 标准曲线-正确或错误的值，指示是否使用标准曲线计算。 斜率-研究人员输入的用于计算的斜率值。 Y截距-研究人员输入的用于计算的y截距值。 底物-包含实验中使用的底物列表的列。 添加项-包含实验中使用的添加项列表的列。 日期-分析运行的日期，格式为YYYY-MM-DD。 原始数据-从实验室

  3. 所属分类：其它

  1. DNA工具包-源码

  2. DNA工具包 DNA工具包由rebelCoder在YouTube上教授： 第1部分：验证和计数核苷酸 第2部分：转录，反向补语 第3部分：GC含量计算 第4部分：翻译，密码子用法 第5部分：开放阅读框 第6部分：阅读框中的蛋白质搜索 第7部分：从NCBI数据库中搜索真正的蛋白质 第8部分：将代码重构为bio_seq类 第9部分：RNA，辅助功能

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：10kb
    • 提供者：weixin_42181545

  1. 昆虫：信息序列分类树-源码

  2. 信息序列分类树 insect是一种R包，用于通过分类识别由DNA元条形码分析产生的扩增子序列变体。 软件包中实现的学习和分类算法基于完整的概率模型（轮廓隐式马尔可夫模型），并提供了高度准确的分类ID，尽管计算成本较高。 该软件包还包含用于从NCBI搜索和下载参考序列和分类信息的功能，用于序列修整的“虚拟PCR”工具，用于清除错误标记的参考序列的功能以及其他一些工具。 insect被设计为与管线或其他产生一系列扩增子序列变体（ASV）的去噪工具结合使用。 尽管未过滤的序列也可以进行高精度处理，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-17
    • 文件大小：135kb
    • 提供者：weixin_42120283

  1. sigminer：:evergreen_tree:一个易于使用且可扩展的工具包，用于R中的基因组改变签名（又名突变签名）分析和可视化-源码

  2. Sigminer：R中的突变签名分析和可视化 总览 癌症基因组在其生命周期中受到各种突变过程的影响，这些突变过程源于外源和细胞内在的DNA损伤，以及易于出错的DNA复制，留下了称为突变特征的特征性突变谱。 该软件包sigminer可以帮助用户从基因组变更记录中提取，分析和可视化签名，从而为癌症研究提供新的见识。 有关管道工具，请参见其共同进化的CLI 。 SBS签名： 复制号码签名： DBS签名： INDEL（即ID）签名： 基因组重排特征： 不支持RS的sig_tally()

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-05
    • 文件大小：11mb
    • 提供者：weixin_42151373

  1. methyl.O:差异甲基化区域分析-源码

  2. 注释，评分和可视化差异甲基化区域 文档和联系方式 介绍 在过去的几年中，新一代测序技术适应表观遗传学研究，彻底改变了研究DNA甲基化状态的能力。 尽管新技术的发展以及对表观基因组学的兴趣日益浓厚，但可用工具的面貌并未为注释提供广泛的可能性。 在这里，我们介绍了methyl.O，R软件包和专注于甲基化分析的在线工具。 尽管实用的用户界面使非生物信息用户受益，但R包允许经验丰富的人员执行甲基化分析，并对参数进行更深入的控制。 用户界面也可以通过R在本地运行，以方便进行初步分析并轻松可视化数据分布和甲

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-30
    • 文件大小：313mb
    • 提供者：weixin_42098830

  1. os-genesis:在Linux上自动管理系统软件包的工具-源码

  2. 操作系统起源 :globe_showing_Asia-Australia: :dna: :building_construction: :laptop: 设置和管理Linux开发环境的简便且可预测的方式 文献资料 执照 根据发布。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-30
    • 文件大小：23kb
    • 提供者：weixin_42169245