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  1. EDM设置:ExomeDepthMod-源码

  2. **** 正在开发中 ***** 背景 是从外显子组测序数据中检测拷贝数变异(CNV)的最灵敏工具之一。 ExomeDepth是一个R包,在R / ExomeDepth中处理大型数据集是一个挑战。 为了解决此问题,EDM实现了ExomeDepth管道,并内置了两个主要更改。首先,EDM使用mosdepth计算外显子的覆盖率,并出于性能原因对算法进行近似选择参考面板。 EDM使用并行运行管道(计数读取和变量调用)。 步骤1:设定环境 EDM取决于包括R软件包在内的几种软件工具。 我们使用conda
  3. 所属分类:其它