您好,欢迎光临本网站![请登录][注册会员]  

搜索资源列表

  1. 软件测试相关论文-英文原文82篇

  2. Alansari2017- A Distributed Access Control System for Cloud Federations .pdf Anon2017-Detecting Privileged Side-Channel Attacks in Shielded Execution with Déjà Vu.pdf Arnautov2016- SCONE Secure Linux Containers with Intel SGX.pdf Atamli-Reineh2015 -
  3. 所属分类:软件测试

    • 发布日期:2018-03-21
    • 文件大小:56mb
    • 提供者:sandwichsauce
  1. TASSEL GWAS分析用的

  2. TASSEL GWAS分析用的
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2018-03-31
    • 文件大小:71mb
    • 提供者:qq_41096410
  1. Bioinformatics with R Cookbook-Packt Publishing (2014)

  2. Bioinformatics with R Cookbook. 包括如何用R分析microarray, RNA-seq,GWAS, NGS 数据, 分析蛋白质和核酸序列等等
  3. 所属分类:医疗

    • 发布日期:2018-04-06
    • 文件大小:28mb
    • 提供者:weixin_41952483
  1. mrMLM在R语言下计算QTN位点步骤

  2. 全基因组关联研究(GWAS)已广泛应用于植物代谢组的复杂生物合成过程的研究。以往的研究大多采用单目遗传算法,如混合线性模型(MLM),对实现多位点遗传算法的更有效算法知之甚少。本文报道了6个多位点模型(FASTmrEMMA, FASTmrMLM, isisemi - blasso, mrMLM, pKWmEB, pLARmEB)
  3. 所属分类:讲义

  1. FINDINGNEEDLESINGENOMICHAYSTACKSWITHWIDERANDOMFOREST.pdf

  2. 在SPARK SUMMIT 2017上,Piotr Szul,CSIRO Data63分享了题为《FINDING NEEDLES IN GENOMIC HAYSTACKS WITH “WIDE” RANDOM FOREST》,就介绍全基因组关联研究,变种星火和“诅咒森林”,GWAS使用案例等方面的内容做了深入的分析。
  3. 所属分类:其它

  1. gwas-源码

  2. 用于GWAS和GWAS后分析的奇异容器 该存储库用于使用各种软件和分析工具开发和记录奇异容器,用于GWAS和GWAS后分析。 入门 对于新用户,我们建议阅读入门说明,其中使用一个简约示例(带有plink二进制文件的奇异容器)解释奇异容器的基本用法。 如果您想为开发这些容器做出贡献,请参阅 。 有关具有综合数据的GWAS的教程,请参阅 前提条件(正在运行的教程): 下载在上共享的容器。 从上面的Google Drive文件夹中下载comorment_ref.tar.gz文件,使用tar -
  3. 所属分类:其它

  1. bioi_GWAS:R中的GWAS | R Markdown-源码

  2. bioi_GWAS R中的GWAS | R Markdown [R qqman 玩具模型:Pixieplatin(PxPt)是由Faerie Pharmaceuticals开发的一种新型化学治疗剂。 不幸的是,该药物的主要副作用之一是血小板减少症(血小板计数低),这可能导致危险的内部出血。 用PxPt治疗后,在922个欧洲血统的个体中测量了血小板计数。 在血小板计数(对数转换)表型上执行GWAS。 基因型在PLINK二进制格式文件中( bed/bim/fam ,基因组建立hg19 ),而
  3. 所属分类:其它

  1. SGUL_UK_Lipoedema_GWAS:用于英国Lipoedema GWAS的脚本-源码

  2. SGUL_UK_Lipoedema_GWAS 用于分析UK Lipoedema GWAS的脚本 发现研究:用于分析148个脂溢水患者与5000多个不明社会对照的GWAS数据的脚本 复制研究:在英国基因组学研究环境中用于在27个GEL组份和10,000+个对照中复制发现研究的30个主要变种的脚本。 对于发现研究和复制研究,整个分析目录格式都包含在此存储库中,但是由于目前无法获得数据,因此未包括具有参与者ID的所有基因分型数据和文件。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-08
    • 文件大小:83mb
    • 提供者:weixin_42117037
  1. SNIPar:父母基因型的孟德尔插补,基于家庭的GWAS和多基因评分分析-源码

  2. 斯尼帕尔 SNIPar(父母的单核苷酸插补)是一个python库,用于从核心家庭中观察到的基因型中估算缺失的父母基因型,并进行基于家庭的全基因组关联和多基因评分分析。 主要特点: 给定一个核心家庭中观察到的基因型,估算缺失的父母基因型(impute_runner.py)。 使用观察到的和估算的父母基因型(fGWAS.py)执行基于家庭的GWAS。 使用观察/估算的父母基因型从SNP权重计算先证者,兄弟姐妹和父母的多基因得分,并进行基于家庭的多基因得分分析(fPGS.py脚本)。 文献资料
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-04
    • 文件大小:11mb
    • 提供者:weixin_42120275
  1. snpsettest:使用GWAS摘要统计信息的基于集合的关联测试-源码

  2. snpsettest snpsettest的目标是提供使用GWAS摘要统计信息执行基于集合的关联测试(例如,基于基因的关联测试)的简单工具。 该软件包目前正在开发中。 在snpsettest包A基于集合的关联检验是基于描述的统计测试 (VE rsatile克烯基于ssociation小号tudy),它结合了一组SNP占标志之间的连锁不平衡的效应。 与原始的VEGAS实现相比,此软件包使用了一种更有效的方法来计算集级别的p值,从而显着减少了计算时间。 安装 要安装此软件包, devtools
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-27
    • 文件大小:832kb
    • 提供者:weixin_42108054
  1. gwasglue:将GWAS数据链接到R中的分析工具-源码

  2. 瓜斯胶 正在开发中 此R程序包充当可以读取或查询GWAS摘要数据的程序包与可以分析GWAS摘要数据的程序包之间的管道。 它位于GWAS数据和分析的一般生态系统中: 上图描述了我们计划连接的一组软件包。 以下是已完成和尚待执行的操作的列表: 数据源 精细映射 - -待办事项 共定位 -TODO -TODO 待办事项 孟德尔随机 -TwoSampleMR的端口 来自TwoSampleMR的端口 - 端口 待办事项 待办事项 可视化 轨迹缩放图,例如[ 安装 您可以使用以下命令安
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-24
    • 文件大小:754kb
    • 提供者:weixin_42118423
  1. pheweb:一种用于构建多表型GWAS浏览器的工具-源码

  2. 有关示例,请参见 。 有关演示的演示,请参见。 如果您有任何疑问或意见,请查看我们的。 如何引用PheWeb 如果您使用PheWeb代码库进行工作,请引用我们的论文: Gagliano Taliun,SA,VandeHaar,P。等。 使用PheWeb探索和可视化大规模遗传关联。 Nat Genet 52,550–552(2020)。 如何为您的数据构建PheWeb 如果这些步骤中的任何一个不正确,请,我将看看我可以做些什么来改进。 1.安装PheWeb pip3 install phe
  3. 所属分类:其它

  1. 牛肝菌:牛肝菌结构,GWAS和RNAseq-源码

  2. 牛肝菌:牛肝菌结构,GWAS和RNAseq
  3. 所属分类:其它

  1. GWAS-颜料:此存储库包含用于质量控制和数据可视化的脚本-源码

  2. GWAS色素沉着 该存储库包含用于分析色素沉着项目数据的脚本。 它包含R,shell和Python(Jupiter)脚本。
  3. 所属分类:其它

  1. qqman:一个R包,用于根据GWAS结果创建QQ和曼哈顿图-源码

  2. qqman:一个R包,用于根据GWAS结果创建QQ和曼哈顿图
  3. 所属分类:其它

  1. GWA_tutorial:关于GWAS和PRS的综合教程-源码

  2. GWA_tutorial:关于GWAS和PRS的综合教程
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-05
    • 文件大小:31mb
    • 提供者:weixin_42116713
  1. MendelIHT.jl:迭代硬阈值作为GWAS的多元回归模型-源码

  2. 孟德尔 迭代硬阈值-一种用于分析全基因组关联研究(GWAS)数据的多元回归方法 文献资料 建立状态 代码覆盖率 安装 下载并安装 。 在Julia内,复制并粘贴以下内容: using Pkg Pkg.add(PackageSpec(url="https://github.com/OpenMendel/SnpArrays.jl.git")) Pkg.add(PackageSpec(url="https://github.com/OpenMendel/VCFTools.jl.git")) Pkg.
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-03
    • 文件大小:34mb
    • 提供者:weixin_42125770
  1. Rgwas:通过GLM执行GWAS-源码

  2. 格瓦斯 通过GLM执行GWAS
  3. 所属分类:其它

  1. launch-ukbb-gwas:在UKBB中运行GWAS-源码

  2. 启动ukbb-gwas 在UKBB上的远程节点上运行GWAS 默认值 等级归一化定量结果 QuantOutcomeRankNorm =假 提取无关的人 doExtractUnrel = FALSE 最小等位基因计数以过滤最终结果并绘制图 minmac = 3 最小等位基因频率以过滤最终结果并绘制图 minmaf = 0 在bgen文件中运行关联测试时,最小插补得分可过滤变体 mininfo = 0.4 首次启动之前 请输入ssh ubuntuhunt-ukbb-iaas-theem 密码是ub
  3. 所属分类:其它

  1. genewa:liClimente-González等人的笔记本。 (2020),结合网络引导的GWAS来发现乳腺癌的易感性机制-源码

  2. 在此存储库中,我们在上评估了六个基于网络的GWAS工具。它包含以下文章的随附脚本,结果和实验室笔记本: Climente-GonzálezH,Lonjou C,Lesueur F,GENESIS研究组,Stoppa-Lyonnet D等。 (2021)使用生物网络提高GWAS:对家族性乳腺癌易感性的研究。 PLOS计算生物学17(3):e1008819。 该存储库分为四个主要子文件夹: :包含用于运行实验的mai Pieces代码。 :包含实验结果。通常,每个子文件夹都包含一个脚本r
  3. 所属分类:其它

« 12 3 »