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ICAnet:独立组件分析解密功能模块,可实现更好的单元聚类和注释-源码
基于独立成分分析的基因共表达网络推论(ICAnet)来解密功能模块,以实现更好的单细胞聚类和批次整合 互联网 我们在单细胞聚类中引入了独立成分分析(ICA),以将基因表达矩阵分解为许多独立成分。 每个独立的成分均以共表达模式为特征,并与某些有意义的生物学途径相关。 这种概念使ICAnet能够识别不同批次数据集之间的共享基因共表达模块。 基于这样的想法,即源自同一细胞类型的不同批次的scRNA-seq数据集不会显示出完全相同的基因表达模式,但关键的共表达模块通常倾向于保持相似的ICAnet对,从而
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:3145728
提供者:
weixin_42146086