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ROAD:ROAD使用RNA折纸方法促进了RNA纳米结构的设计-源码
道路:RNA折纸自动化设计 ROAD软件包使用RNA折纸方法使RNA纳米结构的设计自动化,并包括以下主要程序: RNAbuild-从蓝图生成3D PDB坐标文件。 左轮手枪-重复突变随机化的RNA起始序列,直到在ViennaRNA折叠模型下折叠成目标2D结构。 Batch_revolvr-多次运行Revolvr以为同一蓝图创建不同的候选设计。 RNAvis-分析和设计蓝图中的一条潜在折叠路径并设置其动画效果。 flip_trace-在所有四个可能的方向上输出一个蓝图。 trace_a
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-14
文件大小:254kb
提供者:
weixin_42116604