模拟 此仓库的目的是允许用户在一系列多样性条件下模拟我们的“人口单体型”管道。我们在此使用的重点示例来自Heliconius erato系统。 从广义上讲，此模拟方案创建了一组具有不同单倍型的二倍体个体，并允许它们之间进行重组。然后，它针对每个单倍型模拟短读（具有罕见的测序错误），并针对规范的参考基因组装配进行映射。一个单独的Perl脚本将模拟分子（每个分子均由beadTag的SAM标签“ BX”标记），然后从映射的读取集（作为BAM文件）中进行选择，以形成链接的读取。然后将成对的带有BX标签的