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资源分类
搜索资源列表
smith waterman算法
smith waterman 序列比对 java 自己编的。 附英文论文。 测试数据在代码中有
所属分类:
Java
发布日期:2011-10-28
文件大小:1mb
提供者:
apopplo
真正的smith waterman算法
smith waterman算法
所属分类:
C++
发布日期:2012-08-24
文件大小:2mb
提供者:
homeangel99
fasta算法,Smith-waterman算法,编辑距离算法,最长公共子串算法
fasta算法,Smith-waterman算法,编辑距离算法,最长公共子串算法
所属分类:
C/C++
发布日期:2017-02-21
文件大小:209kb
提供者:
bigfish_yukang
序列比对-Needleman-Wunsch Smith-Waterman algorthm(java)
Needleman-Wunsch 算法(附java代码) Smith-Waterman 算法(附java代码)
所属分类:
Java
发布日期:2009-03-04
文件大小:105kb
提供者:
shaoz
DNA序列局部比对算法
Smith-Waterman 算法的实现 配对 错位 缺失后得到的分值
所属分类:
Java
发布日期:2018-03-09
文件大小:14mb
提供者:
sinat_32676193
双序列全局比对算法与双序列局部比对算法
使用Perl编程语言实现了双序列全局比对Needleman Wunsch算法,以及双序列局部比对Smith Waterman算法。该资源也可在github上下载:https://github.com/GouXiangJian/two_seq_alignment
所属分类:
算法与数据结构
发布日期:2019-07-05
文件大小:6kb
提供者:
qq_41773471
Progenepredict:该存储库包含基于python的Progenepredict程序,该程序基于开放阅读框和Shine-Dalgarno序列在原核基因组中进行了新基因预测-源码
Progenepredict自述文件 Progenepredict软件基础: Python编程语言(v3.9.2) 用于数组计算的软件包NumPy(v1.20.1) 简介和工作流程 介绍: Progenepredict是原核基因组中从头基因预测的工具。它的预测过程基于调查所有阅读框,以了解在其起始密码子附近带有Shine-Dalgarno(SD)序列的开放阅读框(ORF)的存在。 工作流程: 输入文件: FASTA文件,其中包含与原核基因组正向链(5'至3')相对应的序列。 程序: 1.反
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-20
文件大小:20kb
提供者:
weixin_42131785
异构CPU-GPU系统上的改进Smith-Waterman算法
异构CPU-GPU系统上的改进Smith-Waterman算法
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-06
文件大小:2mb
提供者:
weixin_38708361
对齐算法-源码
对齐算法 这个简单的网络应用程序通过Smith-Waterman和Needleman-Wunsch算法对两个字符序列进行本地和全局对齐。 在我的上查看。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:7kb
提供者:
weixin_42113754
delta:Delta是在Go中实现的命令行差异工具-源码
三角洲 Delta既是Go库又是用于文本差异的命令行实用程序。 差异可以在浏览器中显示,也可以使用--cli标志在命令行中--cli 。 安装 brew install octavore/tools/delta 描述 Delta实现了两个差异函数:Smith-Waterman和直方图差异。 是一种动态编程算法,用于对齐两个序列,在这种情况下为文本序列。 它起源于生物信息学,用于比对DNA序列。 是一种diff算法,它首先在JGit实现,然后移植到git ,在这里可以与git diff --h
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-05
文件大小:150kb
提供者:
weixin_42136826
FuzzyFind:一个对字符串执行模糊搜索查询的Swift包-源码
模糊查找 一个带有实用程序的Swift软件包,它使用Smith-Waterman算法的修改版来执行模糊搜索。 此实现是RúnarBjarnason实现的的移植。 用法 该软件包包括两个核心功能: bestMatch和fuzzyFind 。 使用bestMatch ,您可以将查询的最佳对齐方式转换为单个字符串(如果可能的话): import FuzzyFind let alignment = bestMatch ( query : " ff " , input : " FuzzyFind "
所属分类:
其它
发布日期:2021-04-01
文件大小:10kb
提供者:
weixin_42134234