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搜索资源列表

  1. XAT软件系统设计与实现

  2. 本文的主要工作是通过研究序列比对算法,实现一个cDNA/mRNA序列与DNA序列的跨物种比对软件XAT(cross-Alignment Tool)。本文主要借鉴了blastz软件的跨物种方法和sim4软件的intron与exon的边界确定方法。本文实现的方法允许多条cDNA/mRNA序列与整个基因组的比对,同时给出结果的统计值,另外,XAT软件通过设定配置文件,增加了用户的使用方便性和灵活性,XAT软件用C语言编写,容易移植。 本文首先介绍了序列比对的概念、数学模型和一些通用的算法,主要阐述了

  3. 所属分类：C

    • 发布日期：2009-05-23
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：niekaiyuan

  1. DNAMAN使用方法

  2. 主要讲解内容： DNA序列的限制性酶切位点分析 DNA序列比对分析 序列同源性分析 PCR引物设计 质粒模式图绘制

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-06-30
    • 文件大小：389120
    • 提供者：anljbb

  1. dna相似性算法分析

  2. 本人独家编写，88分毕业设计+论文绝对独一无二

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2009-07-05
    • 文件大小：413696
    • 提供者：gaohuijun2009

  1. 时间序列分析 ppt

  2. 如果对比较复杂的纯粹时间序列进行详细的分析，指数平滑往往无法满足要求。而若想对有独立变量的时间序列进行预测，指数平滑更是无能为力，于是需要更加强有力的模型。比指数平滑要有用和精细得多的模型是Box—Jenkins引入的 模型，该模型的基础是自回归和移动平均模型。

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-08-21
    • 文件大小：338944
    • 提供者：mulanzi

  1. Primer Premier 5

  2. Primer Premier 用于引物设计及序列比对

  3. 所属分类：C/C++

    • 发布日期：2009-12-10
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：lwangyooucao

  1. 用低通插值按更高的采样率对数据重采样

  2. % INTERP 用低通插值按更高的采样率对数据重采样 % A. Y = INTERP(X,R) 对矢量X 序列比原采样率高 R 倍重采样.

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-12-24
    • 文件大小：6144
    • 提供者：ddlluu

  1. 生物信息学中的计算机技术

  2. 生物信息学中的计算机技术 原书名： Developing Bioinformatics Computer Skills 生物信息学是一门正在迅速发展的科学，它使用计算和分析方法来解决生物学问题。当前，基因组测序项目正在处理着来自许多不同生物体的大量生物学数据，并且，越来越多地把这些数据保存在公共数据库中。即使是该领域中最积极的研究者，也不可能离开计算机工具的帮助进行工作。生物信息学研究的就是如何建立这些工具。 本书以一种清晰、活泼的方式，全面介绍了生物信息学领域中最重要的一些主题。本书介绍并解

  3. 所属分类：专业指导

    • 发布日期：2009-12-27
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：plmoknhlg

  1. Algorithm Design（英文版）

  2. 经典算法设计教程 目录: 第1章 引言：某些典型的问题 1.1 第一个问题：稳定匹配 1.2 五个典型问题 带解答的练习 练习 注释和进一步的阅读 第2章 算法分析基础 2.1 计算可解性 2.2 增长的渐近阶 2.3 用表和数组实现稳定匹配算法 2.4 一般运行时间的概述 2.5 更复杂的数据结构：优先队列 带解答的练习 练习 注释和进一步的阅读 第3章 图 3.1 基本定义与应用 3.2 图的连通性与图的遍历 3.3 用优先队列与栈实现图的遍历 3.4 二分性测试：宽度优先搜索的一个应用

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2010-01-22
    • 文件大小：14680064
    • 提供者：haizhanmeng

  1. 电子琴、编曲、序列生成、格式转换、格式整理软件（编程辅助工具）

  2. 格式整理软件文明文档 一、整体功能描述： 1、 格式整理软件，具有多种格式整理功能，如普通的行列转换、编辑（自定义插入行、删除行）等； 2、 集成了C与汇编语言整理功能，尤其对经常从网上收集代码、对格式排列有比较高的编程者适用，只需要单击一次按键，即可将杂乱的代码排列整齐，同时自动修正中文代替英文符号所产生的错误； 3、 本软件还可以生成多种格式自定义数字序列、随机数序列， 支持16进制、10进制，自定义生成的数字序列的前缀字符、后缀字符，分隔方式等； 4、 本软件还集成了一款多音色电子琴，全

  3. 所属分类：C

    • 发布日期：2010-02-24
    • 文件大小：4194304
    • 提供者：friend202020

  1. 求一个整数序列的最长递增子序列.doc

  2. 用递归算吧 如果不考虑时间空间代价的话 具体思路： 第一题： 如果已知一个序列中最长的不下降子序列长度，那么这个序列前面添加一个数之后的最长的不下降子序列长度可能加1，这与原来的最长不下降子序列中最大的两个数有关。 具体是，如果加的数比子序列最大值大，长度加1。否则不变。 递归过程需要记录最长不下降子序列的前两个元素的值。 用c写的代码如下，我试了试结果是对的

  3. 所属分类：C

    • 发布日期：2010-03-19
    • 文件大小：39936
    • 提供者：lkzc99

  1. Bioinformatics A Practical Guide(英文版)

  2. 一本介绍关于生物信息序列比对，进化树等算法，以及一些生物信息学常用网站，数据库和工具的书本。本人从事生物信息学研究，认为是一本不错的工具书。。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2010-04-03
    • 文件大小：12582912
    • 提供者：jiuyizhizhu

  1. 一个新的家蚕BmUFP基因的序列分析和原核表达

  2. 一个新的家蚕BmUFP基因的序列分析和原核表达，胡波，张耀洲， 从本实验室构建的家蚕cDNA文库中克隆到一条新的基因序列，GenBank登录号为BAD05929，经Blastn及氨基酸序列同源性比对后,发现该基因是一个

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-28
    • 文件大小：528384
    • 提供者：weixin_38631042

  1. 使用序列模型学习表型结构

  2. 先进的微阵列技术能够同时监视所有基因的表达水平。微阵列数据分析中的一个重要问题是发现表型结构。目标是：1）找到与不同表型（例如疾病或正常表型）相对应的样品组，以及2）对于每组样品，找到使该组与其他组区别开的代表性表达模式或特征。已经针对该问题提出了一些方法，但是，共同的缺点是所识别的签名通常包括大量的基因，但是辨别力却很低。在本文中，我们提出了ag *序列模型来解决这一局限性，其中基因之间的有序表达值被有效利用。与现有方法相比，所提出的序列模型对噪声更鲁棒，并允许使用更少的基因以更大的判别力发现

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-20
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_38733875

  1. bamcov:快速计算和可视化比对文件中的序列覆盖率-源码

  2. ┌┐ ┌─┐┌┬┐┌─┐┌─┐┬ ┬ Quick calculation and visualization ├┴┐├─┤││││ │ │└┐┌┘ of sequence coverage on the terminal └─┘┴ ┴┴ ┴└─┘└─┘ └┘ v0.1 安装 git clone --recurse-submodules https://github.com/fbreitwieser/bamcov cd bamcov

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-18
    • 文件大小：271360
    • 提供者：weixin_42155721

  1. LZ字分布研究及其在序列比较中的应用。

  2. Lempel-Ziv复杂性已被广泛用于序列比较，并取得了可喜的结果，但是直到现在，尚未研究详尽历史中组件的分布。 本文研究了LZ单词的整体分布，并提出了一种用于序列比较的新统计方法。 考虑到组件的长度，我们修改了Lempel-Ziv的复杂度，并获得了各种LZ词集。 我们没有计算LZ单词的内容，而是定义了一系列LZ单词集的设置操作来比较生物序列。 为了评估该方法的有效性，我们进行了两组实验，并将其与基于比对的方法进行了比较。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-16
    • 文件大小：1044480
    • 提供者：weixin_38617604

  1. dozyg:到图映射器的序列-源码

  2. zy “dozey-G”：的序列， 基 概述 dozyg是一个图谱映射器序列，它利用大多数基因组变异图共有的几个属性来实现类似于同类最佳方法的运行时间，以实现与参考基因组的阅读比对。 大多数全基因组变异图具有“流形”线性特性。 也就是说，它们可能在全球范围内具有大规模的结构变化，但是它们在本地通常是线性的或部分可排序的。 我们可以对这些图进行排序，以使它们的共线区域在排序顺序中连续表示（例如，使用odgi sort ）。 这使我们可以使用有效的共线链接方法来查找目标映射，并在本地应用PO

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-12
    • 文件大小：107520
    • 提供者：weixin_42160425

  1. 使用序列模型学习表型结构

  2. 先进的微阵列技术能够同时监视所有基因的表达水平。 微阵列数据分析中的一个重要问题是发现表型结构。 目标是：1）找到与不同表型（例如疾病或正常表型）相对应的样品组，以及2）对于每组样品，找到使该组与其他组区别开的代表性表达模式或特征。 已经针对该问题提出了一些方法，但是，共同的缺点是所识别的签名通常包括大量的基因，但是辨别力却很低。 在本文中，我们提出了ag *序列模型来解决这一局限性，其中基因之间的有序表达值被有效利用。 与现有方法相比，所提出的序列模型对噪声更鲁棒，并允许使用更少的基因以更大的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-03
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38536267

  1. POP序列-源码

  2. 分析POP-seq数据的管道（从比对到峰调用） 图1： K562细胞中POP-seq方案的完整工作流程和数据分析（A）使用trizol裂解细胞以产生三个相（水相，相间和有机相）。 使用RNase A / T1混合物，蛋白酶K和DNase消化来自POP-seq变体的细胞裂解液，然后进行r-RNA消耗，RNA质量检查和文库制备以进行照明测序（B）POP-seq数据处理和下游分析的工作流程。 先决条件 根据用户手册安装以下软件： fastqc（ ） Samtools（ ） Bedtools

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：970752
    • 提供者：weixin_42134234

  1. 基于立体视觉的板料塑性应变比测量

  2. 提出一种测定板料塑性应变比的新方法。在对双相机进行离线标定以后，利用双相机动态采集板料在单向拉伸时表面变形过程的数字图像，获取在时间轴上相同步的两套图像序列；对这些图像采用立体视觉技术和数字图像相关方法重建各个变形时刻板料表面三维外形；并根据有限应变理论计算局部最大最小主应变；最后利用均匀塑性变形期间相同变形时刻局部应变近似相等的性质，换算出长度与宽度方向的应变，进而计算出板料的塑性应变比。在GB/T 5027-2007标准规定的实验条件下完成了对深冲铝板6016T4PD，硬铝2A12-T4，2

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：4194304
    • 提供者：weixin_38556668

  1. UMA:仅从序列中检测蛋白质域的软件-仅用于历史目的-源码

  2. 乌玛 仅从序列中检测蛋白质域的软件。 不再维护此软件。 仅用于历史目的！ 这项工作是在2002年创建和出版的，现在几乎可以肯定有更好的方法来鉴定蛋白质结构域。 原始的2002年自述文件如下： UMA是一种Perl脚本，它利用多序列比对和二级结构分配来预测多域蛋白中域之间“连接子”区域的位置。 （2002）323，585-598。报告此程序所做的任何预测时，都应引用此文章。 这些指令参考UMA的Perl / Tk实现（版本1.8）。 较旧的命令行版本（1.7）也包含在“命令行版本”文件夹中，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-04-01
    • 文件大小：944128
    • 提供者：weixin_42128015
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