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  1. jcmDNAtools：基于pythonpandas的实用程序，用于分析高通量DNA测序数据-源码

  2. DNA分类器 我将NLP分类器代码与生物信息学代码结合在一起，以识别参考基因组中重复出现的DNA图案，并训练神经网络在两个样本之间进行分类。 1.learnMotifs.py研究了两个参考基因组并确定了指定长度的前100个重复基序 2.tokenizeFastQ.py适用于fastA或fastQ原始数据格式，并使用1中的主题对其进行标记化 3.trainDNAclassifier.py接受来自2的标记化数据，并训练神经网络在两者之间进行分类。 这提供了程序上可扩展的数据管道，可以直接从Ill

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：14680064
    • 提供者：weixin_42131890

  1. 一种基于“基因表达谱”的并行聚类算法

  2. 跨物种的生物序列比较已经被广泛应用于基因功能预测,而越来越多的实验表明序列相似性并不足以保证基因功能相似.为了精确确定基因功能,不仅需要考虑序列性质,还需探索基因表达信息的特性,因为基因表达的改变往往伴随着基因功能的改变.通过聚类分析基因表达谱,可以直观判断协同表达基因及其规律,这是考察基因功能的重要一步.由于生物组织基因表达的复杂性,以及识别表达的microarray技术和理念的不断更新,表达数据的规模也呈指数规律递增,聚类分析遭遇了巨大瓶颈——过高的时空复杂度.根据“基因表达谱”的数据特征,

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-20
    • 文件大小：417792
    • 提供者：weixin_38741531

  1. idseq-web：传染病测序平台-源码

  2. · 传染病测序平台 IDseq是一个无假设的全球软件平台，可帮助科学家识别宏基因组测序数据中的病原体。 发现-确定病原体状况 检测-监视和审查潜在爆发 解密-在大型数据集中查找潜在的感染生物 和合作开放项目。 查看我们的存储库： 前端门户（此处） 生物信息学工作流程 命令行上传界面 管道基准测试工具 查阅我们的以开始在此存储库中以及一般在IDseq中进行开发。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_42103128

  1. flowGraph：通过消除在晶格上建模的特征之间的自上而下的依赖关系，准确选择在流式细胞仪样品类别之间进行区分的细胞群体特征-源码

  2. 流图 flowGraph是一个R软件包，用于在流式细胞仪数据中识别用于疾病诊断的候选生物标记。 通过确定丰度发生显着变化并独立患病的驱动程序细胞群来实现。 flowGraph将细胞计数作为输入，并根据预期比例在流式细胞仪样品中输出每个细胞群体的SpecEnr值。 SpecEnr解释了细胞群体之间的依赖性，因此我们可以使用它来标记仅由于其与样本类别（例如健康与生病）相关而完全或部分发生丰度变化的细胞群体。 引文 flowGraph软件包中使用的SpecEnr统计量背后的理论，证明和算法可以在以下

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：481280
    • 提供者：weixin_42123237

  1. iggy：影响图分析，一致性检查，诊断，修复和预测-源码

  2. iggy + opt_graph iggy和opt_graph中是影响图形和观察到的系统行为（两个测量状态之间签订的变化）的一致性为基础的分析工具。 对于许多（生物）系统，都可以使用因果网络，布尔网络和影响图来描述其组件之间的相互作用的知识库，其中边表示一个节点对另一个节点的正面或负面影响。 iggy实现了用于检查大型数据集一致性的方法，并提供了不一致的解释。 在实践中，这用于识别不可靠的数据或指示缺少的React。 此外， iggy解决了修复网络和相应但经常不一致的测量的问题，以便重新建立

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-16
    • 文件大小：987136
    • 提供者：weixin_42117224

  1. Schweikert-et-al.-2020：Scweikert等人的瞄准距离模型。 2020年-源码

  2. 施韦克特-al.-2020 Scweikert等人的瞄准距离模型。 2020年-“深海虾中生物发光器官变化的视觉感知及其对特定识别的意义” 该文件可计算出最佳的情况，即海藻虾在水下看到生物发光的距离。 该模型不假设背景光，并且依赖于描述这些动物的水的传输特性和视觉生理的测量和估计参数。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-15
    • 文件大小：2048
    • 提供者：weixin_42168830

  1. 埃博拉病毒研究：发现抗埃博拉病毒的新型化合物-源码

  2. 具有最新深度学习方法的药物-靶标相互作用预测工具包 及其在药物虚拟筛选和生物活性预测中的应用 该存储库托管Ebola_research，这是一个基于深度学习的药物-靶标相互作用预测工具箱，具有用于药物用途和虚拟筛查工具箱（使用PyTorch）的应用程序，用于埃博拉药物研究和任何疾病靶标研究。 特征 现实且人性化的设计： 自动识别以完成药物靶标结合亲和力（回归）或药物靶标相互作用预测（二进制）任务。 支持冷靶标，冷药设置以进行可靠的模型评估，并支持单靶标高通量测序测定数据设置。 通过详细的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-14
    • 文件大小：125952
    • 提供者：weixin_42140625

  1. 情节：IO页面可用！-源码

  2. Plotly（肚脐生物多样性控制板） 项目概况 Roza的仪表板需要部分完成。 她有一个完整的人口统计信息面板，现在需要可视化每个志愿者的细菌数据。 具体来说，她的志愿者应该能够识别出腹部纽扣中的前10种细菌。 这样，如果“不可能的牛肉”将某个物种识别为制造合成牛肉的候选者，则Roza的志愿者将能够识别在肚脐中是否发现了该物种。 交付品1 ：创建水平条形图 交付品2 ：创建气泡图 交付品3 ：创建量表 交付品4 ：自定义仪表板 交付品5 ：关于Belly Button生物多样性仪表板分析书面报

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42116672

  1. 个人项目-源码

  2. 个人项目 从基本python到数据清理再到分类再到生成图像以及对图像和接下来的单词进行分类。 该存储库包含小型项目，该小型项目已包含所有上述领域的小型实现。 这进一步加强了对 自然语言处理和深度学习 情感分析-情感分析是指使用自然语言处理，文本分析，计算语言学和生物统计学来系统地识别，提取，量化和研究情感状态和主观信息 文本摘要-自动摘要是一种在计算上缩短一组数据的过程，以创建一个表示原始内容中最重要或相关信息的子集。 除了文本之外，还可以总结图像和视频。 文本分析（数据清理和可视化）-一种

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：41943040
    • 提供者：weixin_42133969

  1. Plotly_deploy-源码

  2. Bellybutton生物多样性 所包含的分析使研究志愿者能够查看自己的仪表板，了解其样品的生物多样性。 已为每个志愿者分配了一个ID号。 使用下拉菜单，志愿者可以选择其个人ID号，并且仪表板将过滤其个人结果。 选中后，面板将显示分配给其ID号的因素（性别，年龄，位置等）。 第一视觉是指示该参与者报告的洗涤频率的量表的量表，其范围为1-10。 第二个视觉效果是条形图，它绘制了样品中鉴定出的最多10种丰富细菌的图。 当我将鼠标悬停在每个栏上时，志愿者可以查看细菌鉴定，而栏本身会显示样本值。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-13
    • 文件大小：91136
    • 提供者：weixin_42118160

  1. 基于链码表示的手臂静脉特征提取与匹配

  2. 针对手臂静脉这一生物特征，提出一种基于链码表示的静脉特征提取及匹配算法。由近红外手臂图像中提取出静脉的骨架结构，并将其分割为若干条曲线段，通过曲线的相对方向、相对位置及形状特征计算匹配曲线对，利用粒子群算法计算匹配曲线间的最优空间变换关系，根据静脉全局变换后点集的重叠情况判断匹配程度。针对来自9个国家的110位实验者组成的手臂图像库进行实验，Rank-1和Rank-10%识别率分别为74.5%和93.6%，优于改进Hausdorff距离及模板匹配方法，表明手臂静脉可作为一种新的生物特征来进行身份

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：10485760
    • 提供者：weixin_38551205

  1. 一种基于局部信息统计的虹膜分块编码方法

  2. 由于虹膜自身的稳定性、非侵犯性、不可更改性等优点,虹膜识别已经成为生物特征身份鉴别领域中的研究热点。但虹膜丰富的纹理和复杂的结构给特征提取和编码带来了很大困难。为尽可能地简化特征提取和编码方法,提高虹膜识别效率,提出了一种基于局部信息统计的虹膜分块编码方法。对原始人眼图像进行虹膜定位等预处理操作,得到归一化的虹膜纹理图像;分别根据虹膜局部信息与全局信息、局部信息与局部信息之间的比较关系进行分块编码;计算了不同虹膜代码之间的汉明(Hamming)距离。根据汉明距离给出识别结果。实验证明该方法有效、

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-12
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38554781

  1. 基于太赫兹光谱的DNA检测及应用综述

  2. 太赫兹波辐射因具备特有的感测能力以及无创和非电离特性而备受关注。DNA分子间的振动模式(扭转、集体振动、氢键和骨架振动)大多处于太赫兹波段。相比红外波段,DNA在太赫兹波段表现出了很多独特的吸收特性。系统地分析了太赫兹时域光谱技术在DNA分子领域的研究进展,阐述了单个碱基、碱基对、DNA的鉴定与识别,以及它们的吸收光谱和振动模式;此外,还介绍了太赫兹波的生物安全性及其潜在应用;最后根据当前的研究现状,归纳了DNA分子在太赫兹光谱研究方面仍然存在的问题,为今后的相关研究提供参考。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38535812

  1. techgig_toi_lost_vote-源码

  2. 我可以＆我会投票 印度几次投票失败的技术解决方案挑战哈克松的解决方案 一个安全，公正的投票系统，可确保从印度任何地方进行正确且加密的选举。 产品特点 公钥基础设施和Hyperledger区块链结构身份技术可确保具有完整加密和安全性的安全投票平台 政府iD证明验证包括最准确的Tensorflow和OpenCv caffemodel面部检测 使用SKimage和OpenCV进行指纹识别以匹配adhaar的生物特征，而无需使用任何外部硬件设备来确保安全性 投票时的语音匹配 分析投票期间选民的行为模式，

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：49283072
    • 提供者：weixin_42150745

  1. fabio-a-oliveira.github.io-源码

  2. Fabio Oliveira的博客+项目+咆哮 关于我：花花公子研究数据科学和机器学习并记录其发展联系信息： ， DD / MM / YYYY（已更新DD / MM / YYYY） [博客]简短而甜美的DS / ML类比的运行列表 2020年11月26日 [项目]作用 基于基因表达和细胞生存力数据预测药物作用机理的统计模型。 作用机制（MoA）是归因于描述其生物活性的物质的标记。 通过能够正确识别分子的MoA，可以随后以有针对性的方式使用它来获得所需的细胞应答。 最终模型是以下几个模型的

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42176612

  1. Tempora：用于时序scRNAseq数据的基于路径的轨迹推断方法-源码

  2. Tempora：使用时间序列单细胞RNA测序数据推断细胞轨迹 介绍 Tempora是一种新颖的细胞轨迹推断方法，它使用来自时间序列scRNAseq数据的时间信息对细胞进行排序。 Tempora使用生物途径信息来帮助识别细胞类型关系，并可以识别重要的时间依赖性途径来帮助解释推断的轨迹。 用法 安装 您可以使用devtools安装Tempora： if ( ! require( ' devtools ' )) { # install devtools install.packages( "

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    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：30720
    • 提供者：weixin_42097208

  1. 室内人体表面红外辐射探测模型

  2. 室内人体红外辐射理论对于人的红外探测、医学治疗、侦探、灾后搜救等领域的应用具有重要作用,而目前对室内人体目标的红外热辐射还缺乏系统、整体描述的探测模型。为提高红外系统对人体的探测和识别能力,从生物传热方程出发,利用红外物理和传热学理论,给出室内人体表面温度场和红外辐射量的理论计算方法,建立了室内着装人体探测模型。在介绍人体组成和体温调节系统的基础上,对室内人体表面温度场进行了系统讨论,分析了影响室内人体红外热辐射的主要因素。实验结果表明,模型所计算的理论值误差在允许范围内。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-10
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_38685538

  1. 相位调制密度假彩色编码

  2. 本文提出一种利用光栅调制的位相图象在白光照射下取零级或一级等低衍射级次,获得彩色化输出图象的新方法。本方法光强利用率高、彩色饱和度好、噪声低、方法简便、易于推广,已在遥感、生物医学等图象处理中收到实际应用效果。彩色图象特征鲜明,易于识别。将黑白图象彩色化一直是图象处理中一个重要课题。在光学上已研究了实现图象彩色化的许多方法。但一般都利用衍射一级或其他高级次的输出图象。本文提出一种获得彩色化输出图象的新方法:用罗奇光栅对待处理的图象抽样,再作漂白处理,使图象上不同的密度信息转换成相应的位相信息,再

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：2097152
    • 提供者：weixin_38703895

  1. 复杂文本网数据的主题建模进展

  2. 文中介绍了大规模文本网数据的主题建模研究的特点和近年来的重要进展.主题建模方法吸引了世界范围的广泛兴趣,并且促进了许多重要的数据挖掘、计算机视觉和计算生物应用系统的发展,包括文本自动摘要、信息检索、信息推荐、主题检测和追踪、自然场景理解、人体动作识别以及微阵列基因表达分析等.文中重点介绍文本网数据的4个主要特点以及对应的主题模型.文本网数据含有动态、高阶、多通路及分布式的结构,而之前的主题模型仅对部分的结构进行建模.而文中讨论了在三维马尔可夫模型的框架下统一对文本网数据的4个结构特点进行建模,并

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：934912
    • 提供者：weixin_38582685

  1. 基于QSA数组计算序列中所有NE重复模式的算法

  2. 序列中重复模式的识别与提取算法在数据挖掘、模式识别、数据压缩、生物信息学等领域中具有广泛的实际应用。提出一种全新的基于QSA数组计算所有带有约束条件的NE重复模式的算法RPT。算法设计中充分考虑了NE重复模式的特征,以建立特征和重复模式检测结果之间的统计联系;算法中的约束条件包括最小周期pmin和最大间距gmax,其可用于筛选符合条件的NE重复模式,并可按照递增序输出所有NE重复模式的出现位置。与已有的基于后缀索引的算法相比,此算法的空间效率得到了提高。在分类属性数据样本集上进行的实验表明,算法

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-09
    • 文件大小：961536
    • 提供者：weixin_38621553
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