说明:Bartelo-ANGSD-最终项目
到目前为止我们所做的3/20
将所有9个样本读取下载到SCU中
对所有9个fastq文件运行FastQC,并制作了multiQC报告。糖尿病小鼠似乎存在问题。
使用主程序集.gtf和.fa文件创建用于STAR比对的参考基因组。我们使用主程序集是因为Merv告诉我们这是一个好主意,并且可以在“下载并开始处理Alignment”文件中找到更好的解释。
使用STAR将参照序列比对读取。
对所有文件运行bamQC,发现没有错误值得我们关注。
在所有对齐文件和生成的多
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