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  1. RNA的可变剪接

  2. 本文详细描述了RNA的可变剪接的剪接过程

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2015-10-21
    • 文件大小：460kb
    • 提供者：tslnet

  1. 高通量测序与大数据分析－农学篇

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：65mb
    • 提供者：licnyyu

  1. 《高通量测序与大数据分析－农学篇》多组学研究.

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：17mb
    • 提供者：licnyyu

  1. 《高通量测序与大数据分析－医学篇》微生物组研究

  2. 测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展，科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序（de novo sequencing），获得该物种的参考序列，为后续研究和分子育种奠定基础；对有参考序列的物种，进行全基因组重测序（resequencing），在全基因组水平上扫描并检测突变位点，发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序（whole transcr iptome resequencing），从而开

  3. 所属分类：讲义

    • 发布日期：2018-01-25
    • 文件大小：22mb
    • 提供者：licnyyu

  1. MISO使用说明

  2. 生物信息软件，专门对转录组进行可变剪接计算，曾经发nature protocol.

  3. 所属分类：Linux

    • 发布日期：2018-12-14
    • 文件大小：908kb
    • 提供者：weixin_43725588

  1. SKIP通过染色质重塑复合体组分SEF的可变剪接调控拟南芥开花时间的生化机制

  2. SKIP通过染色质重塑复合体组分SEF的可变剪接调控拟南芥开花时间的生化机制，佟爱仔，朱末，可变剪接在植物生长发育和逆境胁迫过程中发挥重要作用。Ski-interacting protein (SKIP) 是剪接因子，在拟南芥昼夜节律、非生物胁迫和开花�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-28
    • 文件大小：620kb
    • 提供者：weixin_38688969

  1. SKIP调控SEF pre-mRNA的可变剪接抑制拟南芥开花时间的分子机制

  2. SKIP调控SEF pre-mRNA的可变剪接抑制拟南芥开花时间的分子机制，崔志波，杨文奇，在酵母和哺乳动物中，Ski-Interacting Protein (SKIP) 作为剪接因子和转录的共激活或共抑制因子，调节基因的表达。SKIP参与生物钟相关基因及�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-02-17
    • 文件大小：856kb
    • 提供者：weixin_38748055

  1. Identification of two dazl splicing variants in Japanese flounder (Paralichthys olivaceus)

  2. 牙鲆DAZL两种可变剪接形式的鉴定及功能研究，王旭波，姜佳君，DAZL是DAZ家族的成员之一，同时也是一种重要的RNA结合蛋白。现有研究发现，从无脊椎动物到脊椎动物，dazl特异地表达于雌性和雄性生殖�

  3. 所属分类：其它

  1. RNA二级结构对可变剪接的调控作用

  2. RNA二级结构对可变剪接的调控作用，詹雷雷，金勇丰，可变剪接是真核生物产生蛋白质多样性和调控基因表达的重要机制之一。可变剪接在进行过程中，有多种调控机制参与其中，包括 RNA形�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-02
    • 文件大小：240kb
    • 提供者：weixin_38538312

  1. RNA互斥可变剪接的调控机制

  2. RNA互斥可变剪接的调控机制，岳媛，金勇丰，mRNA前体的可变剪接是基因转录后加工的重要方式之一，是真核生物产生蛋白质多样性和功能多样性的主要来源。互斥可变剪接是可变剪�

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2020-01-02
    • 文件大小：239kb
    • 提供者：weixin_38682406

  1. 一种识别植物替代剪接位点的新颖计算方法

  2. 选择性剪接（AS）通过从高级真核生物中的单个基因生成多个转录异构体来增加蛋白质多样性。 多达48％的植物基因表现出可变剪接，已被证明与某些重要的植物功能有关，例如胁迫响应。 提出了一种结合位置权重矩阵（PWM）和分集增量（ID）的混合特征提取方法，分别表示拼接点附近的基本保守水平（BCL）和两个数据集的相似度。 使用提取的特征，将支持向量机（SVM）应用于对替代和本构剪接位点进行分类。 通过提出的算法，正确分类了80.8％的供体位点和85.4％的受体位点。 预期该新颖的计算方法有望用于鉴定植物中

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-05
    • 文件大小：550kb
    • 提供者：weixin_38660108

  1. WebGMAP：用于将cDNA序列映射和比对基因组的Web服务

  2. 数以千计的生物的基因组通常都伴随着cDNA或EST的序列进行测序。 生物信息学的重大挑战之一是使这些基因组序列和基因组注释以一种用户友好的方式可供普通生物学家使用，以解决有趣的生物学问题。 我们已经创建了一个名为WebGMAP（http://www.bioinfolab.org/software/webgmap）的开放式Web服务，该服务将cDNA基因组比对工具（例如GMAP）与易于使用的数据可视化和挖掘工具无缝地集成在一起。 。 该Web服务旨在促进社区努力，以改善基因组注释，确定准确的基因结

  3. 所属分类：其它

  1. hugedb_framework_code_example：Markdown文档，其中涉及分子生物学方法中使用VastDB框架的案例-源码

  2. VastDB案例示例：哺乳动物中保守的Srrm4目标的鉴定和表征 本文档是《使用浩瀚工具和VastDB框架进行可变剪接的计算分析》一书的随附书。 在那里，我们展示了如何使用broadDB框架中的工具和资源（参见下图）（i）使用RNA序列数据（）量化AS并鉴定差异剪接的AS事件，（ii）执行多个基因组以及对AS事件集进行序列分析（ ），（iii）识别物种间具有基因组和法规保守性的AS事件（ ），以及（iv）帮助对结果进行生物学解释，最终鉴定设计湿实验室实验的有趣的AS事件（ 和 ）。 Vas

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-11
    • 文件大小：17mb
    • 提供者：weixin_42123237

  1. Jutils:差异化拼接事件的可视化工具包-源码

  2. 杰蒂斯 Jutils（1.0版）是用于替代剪接事件的可视化工具包。 Jutils直接支持可视化差分拼接（DS）检测工具MntJULiP，LeafCutter，MAJIQ和rMATS生成的结果，并且可以轻松地与其他DS软件配合使用。 描述于： Yang G，Cope L，He Z和Florea L.（2020年）Jutils：用于差异化可变剪接事件的可视化工具包， Submitted 。 本文中描述的补充和数据可以在“ ”目录中找到。 Copyright (C) 2020-2021, a

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-30
    • 文件大小：100mb
    • 提供者：weixin_42162171