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  1. CEVOpen:公开从事药用活动的植物化学文献的内容-源码

  2. CEVOpen植物油 这是一个项目,用于分析Open Access文献中报道的植物油的组成和活性。 开放文学 使用和ContentMine的getpapers / ami,可获得多达10,000篇有关精油的文章。这些报告部分/全部: 植物身份 先前报告的活动的文献调查 石油化学成分(按化学名称) 实验确定活性(通常针对生物) 辞典 对文献进行分析以提出包含在词典中的术语。所有条款都尽可能链接到Wikidata EssoilDB中的(二项或种)(清洗后的) 尚未转移 [提取方法]和尚未传输的元数
  3. 所属分类:其它

  1. bbd_comm_comp-源码

  2. 用于分析美国山毛榉树皮内生植物群落中真菌群落组成和多样性的回购协议(12/18/2020) 使用repo neonectria_barcoding_012220中的代码进行了生物信息学分析和ASV调用 此回购自ASV调用后进行,LULU后处理 大多数分析将在合并树级别的样本后使用数据(树的随机子集收集了多个树;合并了多个树的效果),但一些分析(例如,不同尺度下的社区组成变化分析)将使用数据插件级别的数据 从本地目录GARNAS_neonectria_barcoding_files_cat_032
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-20
    • 文件大小:38kb
    • 提供者:weixin_42166918
  1. IP-Edit-alpha:Minecraft数据包的早期版本旨在简化沉浸式门户的编辑和门户-源码

  2. IP编辑阿尔法 Minecraft数据包的早期版本,旨在简化从“沉浸式门户”中创建和编辑门户的过程。 ===如何使用=== 首先,您将需要编辑棒。要获得魔杖,请将“ ender of ender”和“翘曲的真菌放在棍子上”一起扔在地上,稍等片刻!你有一根魔杖。 要开始使用魔杖,请在按住门户的同时右键单击它,门户的中间应出现一些粒子,以指示已被选中。要选择多个门户,请在选择时蹲下。 要打开菜单,请在主手中放下魔杖。通过单击文本导航菜单。选择棒模式是指该项目的临时使用。副手可以分配有不同的功能(模
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-19
    • 文件大小:218kb
    • 提供者:weixin_42131276
  1. fungi-farmer:用godot和Blender制作的游戏项目-源码

  2. 真菌农民 用godot和Blender制作的游戏项目
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-18
    • 文件大小:611kb
    • 提供者:weixin_42118701
  1. voiidNetherMushroomDrop:inkvoiid的灵菇掉落数据包-源码

  2. voiidNetherMushroomDrop inkvoiid的灵菇掉落数据包 此数据包更改了翘曲的真​​菌以掉落相应的蘑菇,而不是进行更新。 阻止掉落战利品表: 这些积木每块落下一个蘑菇,并且不会因不溢出物品而增加财富。 虚空疣块也以类似于苹果的速度从叶上随机掉下疣疣。 翘曲的疣块不会掉下疣。 制作: 您可以使用4种真菌制作相应的方块 您无法将这些块重新制作成真菌,这意味着: 由4个方块精制而成的方块只会给您1种真菌 这鼓励玩家使用该真菌来种植另一个巨大的蘑菇,以获得更多的方块
  3. 所属分类:其它

  1. Lichen-fungi-do-not-depend-on-the-alga-for-ATP-production-源码

  2. 地衣真菌不依赖藻类产生ATP 在这里,您可以找到Tagirdzhanova等人的脚本,管道和分析详细信息。 2021年的研究(地衣真菌不依赖藻类来生产ATP)。 饲料包含: 元基因组学分析描述了从原始读取数据到基因组注释的所有步骤,并包含了我们使用的管线。 GC_cov图包含用于生成本文中使用的GC /覆盖图以及其他初步图形的脚本和数据。 系统发育分析包含有关我们如何进行系统发育和dN / dS分析的详细信息,并包含树文件和比对。
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-17
    • 文件大小:146mb
    • 提供者:weixin_42113380
  1. funcoes:真菌-源码

  2. funcoes:真菌
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-17
    • 文件大小:60kb
    • 提供者:weixin_42159267
  1. MetaWorks:MetaWorks是一个灵活的多标记元条形码管道,用于处理从原始fastq.gz文件到分类分配的成对末端Illumina读取-源码

  2. MetaWorks的 MetaWorks由一个conda环境和Snakemake流水线组成,这些流水线将在命令行中运行,以生物信息学方式处理从原始读取到分类分配的Illumina配对末端元条形码。 MetaWorks当前支持许多流行的标记基因扩增子和元条形码:COI(真核生物),rbcL(真核生物,硅藻),ITS(真菌,植物),16S(原核生物),18S(真核生物,硅藻),12S(鱼)和28S(真菌)。 使用RDP分类器进行分类分配,该分类器使用朴素的贝叶斯方法来生成分类分配,并在每个等级上提供
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-14
    • 文件大小:243kb
    • 提供者:weixin_42107374
  1. Protein-Lifetime-Project:此python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算得出-源码

  2. 蛋白质终身计划 该python脚本允许用户遵循N端规则获得细胞中蛋白质的寿命,通过该规则,蛋白质半衰期是由蛋白质序列中的最后一个氨基酸计算出来的。 背景 90年代,亚历山大·瓦尔沙夫斯基(Alexander Varshavsky)和他的团队首先描述了N端规则。 它将蛋白质的体内半衰期与其N末端残基的身份联系起来。 他得出的结论是,N-末端规则的相似但截然不同的版本适用于所有生物,从哺乳动物到真菌再到细菌。 因此,据此,应该有可能从蛋白质序列计算蛋白质的半衰期,并使用生物信息学方法估算蛋白质在细胞
  3. 所属分类:其它

  1. Capstone:肺炎检测的顶点-源码

  2. 什么是肺炎? 肺炎是一种或两种肺部感染。 细菌,病毒和真菌导致了这种情况。 感染会引起肺部气囊的炎症,称为肺泡。 肺炎占国际5岁以下儿童死亡总数的15%以上。 2017年,有920,000名5岁以下的儿童死于该疾病。 它要求训练有素的专家对胸部X光片(CXR)进行检查,并通过临床病史,生命体征和实验室检查进行确认。 肺炎通常表现为CXR上不透明性增加的一个或多个区域。 但是,由于肺部的许多其他状况,例如体液超负荷(肺水肿),出血,体液丢失(肺不张或虚脱),肺癌或术后肺部疾病,在CXR上诊断肺炎很
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-03-11
    • 文件大小:13mb
    • 提供者:weixin_42120283
  1. EffectorP-3.0:真菌和卵菌细胞中质外体和细胞质效应子的预测-源码

  2. EffectorP-3.0:真菌和卵菌细胞中质外和细胞质效应子的预测 什么是EffectorP 3.0? 许多真菌和卵菌纲物种正在破坏植物病原体并分泌效应蛋白以促进植物感染。 真菌和卵菌病原体具有多种感染策略,其效应子不具有序列同源性。 但是,效应子仍然具有统一的特性:它们要么位于细胞外,到植物的质外体,要么位于细胞内,到植物的细胞质。 EffectorP 3.0利用这一生物信号,并分别使用了两个分别在质外体和细胞质效应子上训练的机器学习模型。 对于给定的一组分泌的病原体蛋白质,Effect
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    • 发布日期:2021-03-10
    • 文件大小:10mb
    • 提供者:weixin_42099302
  1. noisefunge.rs:重现Rust中的噪声真菌-源码

  2. 噪音真菌 Noisefunge是基于befunge编程语言的音乐现场编码环境。 特征 针对JACK构建,并且应在该API支持的平台上工作。 提供MIDI输入以接收MIDI节拍时钟消息。 现在,用于处理请求的服务器基于HTTP和json构建。 配置文件可用于自动发送程序选择消息。 用于合成器和效果的子过程和JACK连接管理。 定义自定义操作码的新语义。 查看器中支持Unicode,因此所有256个字节的值均具有可打印的表示形式。 内置琶音器。 录音
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    • 发布日期:2021-03-09
    • 文件大小:52kb
    • 提供者:weixin_42107165
  1. 2021_pms_mt-源码

  2. 2021_pms_mt 该存储库包含用于对...的比较分析中使用的脚本。 download_mt_genomes_gc_hist 包含Snakefile是下载与efetch > 700个真菌基因组的MT,使每个MT基因组的GC含量直方图。 GenBank登录号和mt基因组的其他信息位于TSV文件table_mt_genomes.txt 。 转到此目录并运行: snakemake -j 1 --use-conda 下载所有这些文件可能需要一段时间。 您可以尝试调整线程数( -j )以使
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    • 发布日期:2021-03-09
    • 文件大小:169kb
    • 提供者:weixin_42132359
  1. amfinder:AMFinder套件包含Python脚本,该脚本可从墨迹斑斑的植物根部图片中对菌根结构进行高通量注释,以及用于手动管理和生成热图的功能齐全的浏览器-源码

  2. AMFinder 自动菌根查找器(AMFinder)可以使用卷积神经网络基于计算机视觉自动识别和量化墨水染色的根图像上的AM真菌定植和自由基内菌丝结构。 概括 命令行脚本( amf ) 安装说明 amf至少需要Python 3.6 。 以下是使用虚拟环境安装依赖项的典型安装: $ python3.7 -m venv amfenv $ source amfenv/bin/activate (amfenv) $ python -m pip install -r requirements.tx
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    • 发布日期:2021-03-06
    • 文件大小:123mb
    • 提供者:weixin_42102634
  1. funannotate:真核基因组注释管道-源码

  2. funannotate是用于基因组注释的管道(专门为真菌构建,但也可用于高级真核生物)。 有关安装,使用和更多信息,请参见 最快启动Docker: 您可以使用funannotate运行funannotate 。 需要注意的是,GeneMark不包含在Docker映像中(请参阅下面的许可,您可以向开发人员投诉,因为它难以分发/使用)。 我还编写了一个bash脚本,该脚本可以运行docker映像并自动检测/包括正确的用户/卷绑定。 该docker映像是基于master中的最新代码构建的,因此它将早
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    • 发布日期:2021-02-28
    • 文件大小:537kb
    • 提供者:weixin_42127020
  1. 真菌病-源码

  2. 真菌病 该存储库可帮助贡献者创建 :简短,自包含,正确(可编译),示例。 使用gradle创建一个新项目 在GitHub上分叉此存储库,并将分叉的存储库克隆到您的计算机上。 有关详细信息,请参见。 $ git clone gitgithub.com:YOUR_ACCOUNT/mybatis-issues.git 在克隆的存储库中,执行gradle(gradlew)命令创建一个新项目。 $ ./gradlew -PprojectName=gh-123 -Ptemplate=_simple
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    • 发布日期:2021-02-26
    • 文件大小:434kb
    • 提供者:weixin_42131890
  1. ensembl-client:Ensembl 2020客户端-源码

  2. 合奏客户端 介绍 该存储库是Ensembl网站的全新前端,以React,Rust和WASM编写。 当前的公开发布可以在。 新站点将整合整个分类学领域的基因组,包括脊椎动物,无脊椎动物,植物,真菌和细菌。 如果您对该项目的最新发展感兴趣,请加入我们的Slack频道#ensembl2020或关注我们的。 安装 Ensembl客户端在Node.js上运行,并使用NPM和webpack进行管理。 基因库浏览器所需的所有补充库(例如Rust)都包含在此存储库中。 要安装并运行ensembl-client
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  1. 真菌-源码

  2. 一个真菌秋天的家伙
  3. 所属分类:其它

  1. 肺真菌网-源码

  2. 肺真菌网 项目设置 yarn install 编译和热重装以进行开发 yarn run serve 编译并最小化生产 yarn run build 整理和修复文件 yarn run lint
  3. 所属分类:其它

    • 发布日期:2021-02-24
    • 文件大小:192kb
    • 提供者:weixin_42097668
  1. 数据集成到真菌数据库-源码

  2. 数据集成到真菌数据库
  3. 所属分类:其它

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