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2015-bosc:2015年生物信息学开源大会的摘要和演示材料-Source material
2015-bosc:2015年生物信息学开源大会的摘要和演示材料
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-24
文件大小:104448
提供者:
weixin_42131541
bosc_materials:杂项生物信息学开源会议(BOSC)的文档,https-Source material
bosc_materials:杂项生物信息学开源会议(BOSC)的文档,https
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-24
文件大小:48234496
提供者:
weixin_42131405
bioinf-commons:Kotlin中的生物信息学图书馆-源码
生物常见病 生物信息学图书馆。 内容 org.jetbrains.bio.dataframe像org.jetbrains.bio.dataframe大熊猫 org.jetbrains.bio.experiment命名计算-实验和资源配置 org.jetbrains.bio.genome用于基因组,序列,基因,本体等的API。 containers -基因组位置集API coverage -基因组覆盖率API,配对/单端,片段大小估计 data -描述任何种类的数据集资源,包括重复数据 for
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-22
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42133969
ml-course-project:医学生物信息学2020课程的机器学习项目工作-源码
毫升课程计划 用于2020年医学生物信息学机器学习个别课程项目分配的回购协议。 描述 在此项目中,目标是将各种机器学习(ML)方法应用于选择的数据集并评估其性能。当我在博士学位研究中使用空间转录组学(ST)时,我决定将此类数据集用于该项目。该工作量应相当于大约一个星期的工作。 在此项目中,我选择将ML应用于一组乳腺癌ST数据集,其中每个数据点(“斑点”)均被标注为癌症或健康,并使用ML来查看是否可以仅使用ML来预测这些标签基因表达数据。 代码 使用Jupyter Notebook的Python
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-21
文件大小:44040192
提供者:
weixin_42160278
生物信息学中的课堂失衡学习方法综述
生物信息学中的课堂失衡学习方法综述
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-20
文件大小:455680
提供者:
weixin_38550459
单个基因生物信息学分析视频教程-完整版.zip
单个基因生物信息学分析视频教程-完整版.zip
所属分类:
讲义
发布日期:2021-03-19
文件大小:288358400
提供者:
augace
bio-tools:小型,单一用途的生物信息学工具的集合-源码
生物工具 小型,单一用途的生物信息学工具的集合。 内容 bold2qiime 命令行脚本,用于将格式的数据下载转换为的未对齐fasta和分类法文件,以供q2-feature-classifer使用。 目前正在提取COI-5P序列并在格式化之前推断王国。支持任何纯文本的定期定界文件以及多页excel文件作为输入。 用法: bold2qiime.py -h
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:17408
提供者:
weixin_42134143
bfxapps2:Companion R软件包,用于生物信息学课程的数据科学-源码
bfxapps2:Companion R软件包,用于生物信息学课程的数据科学
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-18
文件大小:7340032
提供者:
weixin_42131443
Bionformatics_beginer-:这是我生物信息学之旅的开始,这使我已经具有使用C,Python,MATLAB,SQL,RStudio,CSS,JavaScript,Flask,Html,Swift和Lua的一些经验。-源码
Bionformatics_beginer-:这是我生物信息学之旅的开始,这使我已经具有使用C,Python,MATLAB,SQL,RStudio,CSS,Javascr ipt,Flask,Html,Swift和Lua的一些经验。
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:3072
提供者:
weixin_42174098
Flock:蜂群生物信息学-源码
Flock:蜂群生物信息学
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:629760
提供者:
weixin_42099087
awesome-bioinformatics-formats:生物信息学格式和出版物的精选清单-源码
很棒的生物信息学格式 生物信息学格式和出版物的精选清单。 这里并不是每种格式本身都是“很棒的”,但是如果您正在考虑创建一种新格式,那么这可能是您首先查看潜在的现有格式的地方。 我们还包括并非特定于生物信息学的格式,但应将其用于生物信息学应用程序。 请随时自己的。 埃达姆 EDAM是生物信息学和计算生物学中普遍存在的,已建立的熟悉概念的综合本体,包括数据类型和数据标识符,数据格式,操作和主题。 EDAM提供了一组带有首选术语和同义词,定义以及一些其他信息的概念-组织成简单直观的层次结构以方便使用
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-17
文件大小:6144
提供者:
weixin_42144201
bio331_2021:2021年生物信息学的注释和代码-源码
bio331_2021 2021年生物信息学的注释和代码
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-16
文件大小:146432
提供者:
weixin_42165980
scripts:我在日常工作中使用的(主要是生物信息学)脚本的集合-源码
scr ipts:我在日常工作中使用的(主要是生物信息学)脚本的集合
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:690176
提供者:
weixin_42137032
LC2B-STARCU:CU肝癌生物学和生物信息学之星库-源码
LC2B-STARCU CU肝癌生物学和生物信息学之星库
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-14
文件大小:7168
提供者:
weixin_42097189
Bioinfo_c_Scripts:生物信息学的C脚本-源码
Bioinfo_c_scr ipts 生物信息学的C脚本 nt_count.c 打印输入序列的核碱基组成 用法 $ gcc nt_count.c -o nt_count $ ./nt_count nt_histogram.c 打印输入的DNA序列的核碱基组成的水平直方图 用法 $ gcc nt_histogram.c -o nt_histogram $ ./nt_histogram aa_histogram.c 打印输入的蛋白质序列的氨基酸组成的水平直方图 用法 $ gcc aa_hist
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:4096
提供者:
weixin_42122838
BioBeginner:进入生物信息学领域的第一站-源码
初学者生物信息学 进入生物信息学领域的第一站
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-13
文件大小:919552
提供者:
weixin_42113380
joe-benthos:胡德运河和圣胡安eDNA序列数据的生物信息学管道-源码
乔·本索斯 概括 最初尝试重现和扩展胡德运河和圣胡安群岛eDNA数据的分析。 上提供了原始数据和原始生物信息学管道。相关的海洋酸化项目和管道可。 初始方法和结果 工作流程 从Gannett检索数据 运行MultiQC 使用解复用样本 dada2的去噪和滤波序列 使用Insect 1.2分配分类单元 要重现此工作流程,请参见 目录结构 /analysis/用于分类单元分配数据整形,数据探索和可视化的代码。 /all.the.useful.tables/分类单元分配和数据整形的输出表。 /code
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-11
文件大小:40894464
提供者:
weixin_42132056
BALSAMIC:癌症体细胞突变的生物信息学分析管线-源码
癌症中体细胞突变的生物信息学分析管线(v 7.1.1) FastQ到带注释的VCF BALSAMIC基本上是其核心工作流管理器的包装器。 目的是要拥有一个具有明确定义的cli的程序包,以使其可重现,使用户无需依赖工作流管理器即可运行体细胞调用。 目前,BALSAMIC正在使用Snakemake作为其核心。 因此,只要创建了适当的配置文件,就可以使用此软件包和标准Snakemake cli中可用的工作流程来运行示例。 源代码 版本 7.1.1 作者 哈桑·福洛维·阿斯 发展模式 Gitfl
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:176160768
提供者:
weixin_42126677
bioinformatics-general_commands:一线命令,用于生物信息学任务-源码
生物信息学中的命令行实用程序 自从论文实习开始以来,我发现并应用了几种不同的命令,以便完成生物信息学中的某些任务。 现在,我是一名博士研究生,但我仍在学习一些执行生物信息学任务的新奇方法。 这是我一直在使用的一些命令。 该页面不断更新。 我还在NGS分析中添加了一些常用的命令配置。 作业系统 所有这些命令都在Linux机器(主要是Ubuntu和CentOS)上执行。 重击 显示第2行的文本文件。 tail --lines=+2 按数字对列2进行排序。 sort -n -k2 打印最后
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-10
文件大小:3072
提供者:
weixin_42097668
rosalind-problems:rosalind.info的生物信息学问题用Java解决-源码
rosalind-problems:rosalind.info的生物信息学问题用Java解决
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其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:5120
提供者:
weixin_42176827
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