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MultiQC:将来自多个样本的生物信息学分析的结果汇总到一个报告中-源码
将多个样本的生物信息学结果汇总到一个报告中 在查找和 MultiQC是一种工具,用于创建具有交互式图表的单个报告,以对多个样本进行多种生物信息学分析。 MultiQC用Python编写(已通过v3.6 +测试)。 它可以在以及通过使用。 通过扫描给定目录以查找可识别的日志文件来生成报告。 解析这些文件,并生成一个HTML报告,其中总结了所有找到的日志的统计信息。 MultiQC报告可以在一个图中描述多个分析步骤和大量样品,并且多个分析工具使其成为常规快速质量控制的理想选择。 MultiQ
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-09
文件大小:2097152
提供者:
weixin_42102713
awesome-bioinformatics-benchmarks:精选的生物信息学基准测试论文和资源清单-源码
很棒的生物信息学基准 精选的生物信息学基准测试论文和资源。 这种格式的功劳是肖恩·戴维斯(Sean Davis)的资料库,而 Ming Tang)的资料库。 如果您的基准研究尚未包含在此列表中,请提出。 内容 收录论文规则 论文必须是3种或更多工具/方法的客观比较。 论文一定很棒。 此列表并不是要编入历史记录,而只是列出那些特别广泛,做得好和/或提供独特见解的基准研究。 通常不应从作者那里发表论文来说明为什么他们的工具/方法比其他方法更好。 基准测试数据应该公开可用,或者模拟代码/方
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:36864
提供者:
weixin_42109732
learning-bioinformatics-at-home:学习生物信息学的资源-源码
在家学习生物信息学 和其他贡献者收集了一些资源,以帮助人们在家学习生物信息学工具(基本的和专业的)。 表中的内容 的Unix 介绍 :假设没有任何以前的经验,则每天直播生物信息学课程。 中间的 先进的 流程替代 一线生物信息学 [R 介绍 :Dana Farber的Rafael Irizarry的课程 :DESeq2和其他R包的作者Mike Love编写的教程 中间的 :基因组规模测定的结构,注释,归一化和解释(免费edX课程) :由Tidyverse和其他许多东西的开发者Hadley Wi
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:4096
提供者:
weixin_42160252
Bioinformatics:各种生物信息学相关算法的实现-源码
生物信息学 各种生物信息学相关算法的实现 酵母染色体数据取自
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-08
文件大小:11534336
提供者:
weixin_42118160
data-structure:用于生物信息学(我的硕士学位)-源码
data-structure:用于生物信息学(我的硕士学位)
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-07
文件大小:5120
提供者:
weixin_42116791
Project-Bioinformatics:项目生物信息学-源码
项目生物信息学 项目生物信息学:尼日尔曲霉 该项目的目的是注释和定位基因组中prtT拷贝的数量,并注释其他可能对使用生物信息学对黑曲霉增强的蛋白酶生产产生影响的突变。 这需要很多步骤步骤1:...
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-06
文件大小:13312
提供者:
weixin_42120283
BioAssignment:罗莎琳德的生物信息学实验室任务-源码
生物分配 罗莎琳德的生物信息学实验室任务
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:137216
提供者:
weixin_42122340
Master-Research-Project:昆士兰大学生物信息学研究硕士项目2021年第1学期-源码
硕士研究项目 昆士兰大学生物信息学研究硕士项目2021年第1学期
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-05
文件大小:4096
提供者:
weixin_42097533
dna-analysis-coursera:Coursera生物信息学代码-源码
dna分析课程 Coursera生物信息学代码
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:9216
提供者:
weixin_42110533
EBI-Github入门:EMBL-EBI生物信息学概论课程的课程材料2021年2月15日至19日-源码
EBI-Github入门:EMBL-EBI生物信息学概论课程的课程材料2021年2月15日至19日
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:38797312
提供者:
weixin_42128141
bpipe:Bpipe-用于运行和管理生物信息学管道的工具-源码
欢迎来到布珀 Bpipe提供了一个平台,用于运行大型生物信息学工作,该工作平台由一系列处理阶段(称为“管道”)组成。 2021年1月-新! 发布了! 下载 (Google论坛) Bpipe已发表在! 如果您使用Bpipe,请引用: Sadedin S,Pope B和Oshlack A,Bpipe:用于运行和管理生物信息学管道的工具,生物信息学 为什么是布珀? 许多使用生物信息学数据的人最终都将工作作为外壳程序脚本运行。 尽管这使它们易于运行,但有很多限制。 例如,脚本中途失败时,通常
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-04
文件大小:11534336
提供者:
weixin_42171132
:[历史]生物信息学的可重复分析-源码
Rabix长大了! 现在可以实现生物信息学的可重复分析! 请参阅 ( ),用于Rabix的语言部分合并到的规范。 ,用于CWL工作流程的可视化编辑器 可以在从笔记本电脑到HPC到云的任何内容上以CWL运行工作流的运行程序的列表。 如果您想查看该项目的旧文档,请参见
所属分类:
其它
发布日期:2021-03-01
文件大小:112197632
提供者:
weixin_42116921
生物信息学-源码
生物信息学 编辑百分比: 对于参考miRNA数据库中核苷酸的每种组合以及在测序中发现的核苷酸,包含在比对读数中发现的变化列表的文件。 基因计数和差异表达: 使用BISEK进行差异表达分析的图表。 还包含通过将测序的Mirna与参考miRNA数据库比对创建的基因计数 公用事业: 用于生成编辑百分比和对齐数据的实用程序功能 Generate_Edit_Counts_And_Percents.py: 编写代码以从对齐文件中获取编辑计数和百分比。 mirna_pipeline.py: 将阅
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:1048576
提供者:
weixin_42134234
主题建模及其在生物信息学中的当前应用概述
主题建模及其在生物信息学中的当前应用概述
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-26
文件大小:1048576
提供者:
weixin_38718434
PAV_table_scripts:用于为生物信息学方法章节构建PAV表的Python脚本:使用Mosdepth创建基因存在缺失表-源码
PAV_table_scr ipts 用于为生物信息学方法一章构建PAV表的Python脚本:使用Mosdepth创建基因存在/不存在表。
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其它
发布日期:2021-02-23
文件大小:1024
提供者:
weixin_42171132
ScBioGrid:支持生物信息学研究的商品超级计算环境
我们已经开发了商品超级计算环境ScBioGrid,以支持生物信息学研究。 作为专用网格,ScBioGrid基于ScGrid,ScGrid是由中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心(SCCAS)提供的科学计算环境。 ScBioGrid门户为SCCAS异构高性能计算机(HPC)上可用的生物信息学资源提供了方便且统一的界面。 在本文中,我们详细描述了ScBioGrid提供的体系结构和服务,并介绍了ScBioGrid的未来工作。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:943104
提供者:
weixin_38717359
生物信息学:用于处理序列的脚本的随机集合-源码
生物信息学 用于处理序列的脚本的随机集合
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:19456
提供者:
weixin_42097189
cbb:计算生物学和生物信息学-源码
cbb:计算生物学和生物信息学
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:27262976
提供者:
weixin_42117082
生物信息学问题-源码
生物信息学问题
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-22
文件大小:20480
提供者:
weixin_42099814
生物信息学算法-源码
欢迎! 该存储库包含我在Phillip Compeau和Pavel Pevzner撰写的《生物信息学算法:一种主动方法》中算法的许多实现。 已针对rosalind.info(与文本相对应的网站)上的数据集测试了该存储库中的每个文件。
所属分类:
其它
发布日期:2021-02-21
文件大小:38912
提供者:
weixin_42126865
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