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搜索资源列表

  1. Hacktoberfest_Contribute_anything:该存储库旨在帮助初学者学习开放源代码的贡献。 该存储库是针对HACKTOBERFEST 2020创建的-源码

  2. 任何贡献 该存储库旨在帮助初学者学习如何做出开源贡献。 该存储库是针对HACKTOBERFEST 2020创建的 指示 请确保您正在贡献的算法或代码在此存储库中已经可用。 如果该程序是一个有竞争力的问题解决方案，请在问题链接中添加注释。 我经常合并请求请求。 应遵循的程序： 步骤1：分叉此存储库。 第2步：将代码添加到其相应的文件夹中，并进行少量说明。 如有必要，创建新文件夹。 步骤3：创建拉取请求。 步骤4：还有Bam！ 我会合并 祝您捐款愉快！

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：22020096
    • 提供者：weixin_42127835

  1. CAMPHOR:SV来电者，可长时间阅读-源码

  2. 樟 SV来电者，可长时间阅读 概述 提取的读物表明来自bam文件的SV的存在 确定SV候选人 使用重复信息和支持读取次数过滤SV候选对象 要求 python3 python的pysam模块 numpy模块 Perl samtools（0.1.18版或更高版本） 输入文件 两个bam文件（一个bam按读取名称排序，另一个bam按基因组坐标排序） 按基因组坐标排序的bam文件的索引文件（.bai） 序列数据的Fastq文件 如果环境中未安装samtools，则可以在配置文件（pram.conf

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-08
    • 文件大小：8388608
    • 提供者：weixin_42107491

  1. 方法-源码

  2. TGG-Viewer链接 （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） （ ） MultiQC链接 数据处理步骤 第一阶段管道 Broad GP目前以hg19 bams的形式提供RNA-seq数据。 当GP提供新样品时，我们 手动将新的.bam和.bai文件复制到gs://macarthurlab-rnaseq/[batch name]/hg19_bams/ 运行step1_update_data_paths_worksheet.py

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-04
    • 文件大小：196083712
    • 提供者：weixin_42131405

  1. htslib：高通量测序数据格式的C库-源码

  2. HTSlib是用于访问常见文件格式（例如的统一C库的实现，该文件格式用于高通量测序数据，并且是和使用的核心库。 HTSlib仅取决于 。 已知与gcc，g ++和clang兼容。 HTSlib实现了通用BAM索引，其文件扩展名为.csi （坐标排序的索引）。 HTSlib文件阅读器首先查找新索引，然后在缺少新索引的情况下查找旧索引。 该项目还包括流行的tabix索引器和bgzip压缩实用程序，该索引器同时对.tbi和.csi格式进行索引。 构建HTSlib 有关完整的详细信息，请参见 。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-04
    • 文件大小：1048576
    • 提供者：weixin_42110038

  1. 白光LED用Sr_3(PO_4)_2∶Eu~(2+)蓝色荧光粉的制备及发光性能研究

  2. 采用高温固相法在N2-H2还原气氛下合成了一系列Sr3(PO4)2∶Eu2+蓝色荧光粉,通过X射线衍射仪(XRD)、荧光光谱仪(PL)对荧光粉的晶体结构、激发和发射光谱进行了表征。结果表明:微量的Eu2+掺杂不会改变其晶体结构;Sr3(PO4)2∶Eu2+荧光粉在310~390nm范围内可以有效的被激发,激发峰位于359nm;发射光谱为主峰位于438nm宽带发射(带宽约为150nm),对应于Eu2+的4f65d1→4f7跃迁.通过高斯拟合发现,Eu2+至少占据了Sr3(PO4)2两种不同的Sr2

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-03-02
    • 文件大小：585728
    • 提供者：weixin_38670297

  1. CDXX：带有V8脚本引擎的Teeworlds 0.7。 发展将是缓慢的:trade_mark:-源码

  2. Teeworlds 复古多人射击游戏 Teeworlds是一款免费的在线多人游戏，适用于所有主要操作系统。 在各种游戏模式中与多达16位玩家进行战斗，包括“团队死亡竞赛”和“夺旗”。 您甚至可以设计自己的地图！ 该软件按“原样”提供，没有任何明示或暗示的保证。 作者概不承担因使用此软件引起的任何损失的责任。 有关完整的许可证文本（包括版权信息），请参见license.txt。 请访问了解有关该游戏的最新信息，包括新版本，自定义地图等。 最初由Magnus Auvinen撰写。 Teewo

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-28
    • 文件大小：25165824
    • 提供者：weixin_42126668

  1. DROMPAplus：ChIP-seq管道工具，用于对多个ChIP-seq样本进行质量检查，标准化，统计分析和可视化-源码

  2. DROMPAplus 1.概述 DROMPA（DRaw和观察多种浓缩曲线和注释）是一种ChIP-seq管道工具，可满足各种需求，包括质量检查，分析和多个ChIP样品的可视化。 DROMPAplus用C ++编写，具有许多有价值的功能。 DROMPAplus： 接受多种地图文件格式（SAM，BAM，CRAM，Bowtie，TagAlign（.gz））并读取分发格式（WIG（.gz），bigWig，bedGraph）。 支持加标归一化和总读取归一化。 输出用于ChIP-seq分析的各种质量指

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    • 发布日期：2021-02-26
    • 文件大小：25165824
    • 提供者：weixin_42097914

  1. jmespath.php：在PHP中以声明方式指定如何从JSON文档中提取元素-源码

  2. jmespath.php JMESPath（发音为“ jaymz路径”）允许您声明性地指定如何从JSON文档中提取元素。 jmespath.php允许您在具有PHP数据结构PHP应用程序中使用JMESPath。 它需要PHP 5.4或更高版本，并且可以使用mtdowling/jmespath.php软件包通过安装。 require 'vendor/autoload.php' ; $ expression = 'foo.*.baz' ; $ data = [ 'foo' => [

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    • 发布日期：2021-02-25
    • 文件大小：27648
    • 提供者：weixin_42136826

  1. SingleMoleculeFootprinting：用于SMF数据分析的R包-源码

  2. 单分子印迹 介绍 SingleMoleculeFootprinting是围绕构建的R软件包，专门用于分析单分子足迹（SMF）数据。 SMF是在开发的一种高通量测序技术。 它包括使用外源甲基转移酶在GpC和CpG环境中标记可及的基因组胞嘧啶，以及随后进行的亚硫酸氢盐测序（BS）。 因此，受DNA相互作用蛋白（例如TF，核小体，GTF等）结合保护的胞嘧啶将被甲基化，而可及的胞嘧啶将被甲基化。 使用本程序包，我们提供了从对齐的bam文件到单个站点结果的生物学解释，执行基本SMF数据分析的功能。 前

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    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：4194304
    • 提供者：weixin_42176827

  1. rust-gadgets：用rust编写的小工具集合-源码

  2. 锈小配件 在Rust写的小配件收藏。 列表 每年的星期：获取今年的星期数。 table-filter：基于正则表达式的tsv / csv文件过滤器。 说明标志：根据解释山姆标志 fastq-merge：将目录中的fastq对合并为一对。 fastq-check：Fastq格式检查和数量计数。 splitted-dicordant-extract：根据从sam / bam中提取拆分和不一致的读数。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：15728640
    • 提供者：weixin_42157188

  1. snipgenie：用于微生物变异调用的命令行和桌面工具-源码

  2. 尼古丁 SNiPgenie是用于从原始读取数据进行微生物变异调用和系统发育分析的工具。 它最初被编写为与牛分枝杆菌的细菌分离物一起使用，但可以应用于其他物种。 您需要高质量的参考基因组来进行比对。 鼓励对使用该软件感兴趣的任何人提出有关改进或添加功能的建议。 该软件是用Python编写的。 它是在Ubuntu linux上开发的，但设计为也可以在具有独立应用程序的Windows 10上运行。 GUI是使用PtSide2使用Qt工具包制作的。 当前功能 加载多个fastq文件并一起处理 查看f

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-24
    • 文件大小：40894464
    • 提供者：weixin_42132325

  1. mycosnp-bwa-reference：此工作流程使用BWA为MycoSNP工作流程准备参考索引-源码

  2. MycoSNP GeneFlow工作流程：BWA参考 概述 MycoSNP包括以下三个GeneFlow工作流程集： MycoSNP BWA参考：通过屏蔽参考中的重复并生成BWA索引，为BWA对齐和GATK变体调用准备参考FASTA文件。 MycoSNP BWA预处理：通过将样本与BWA参考索引对齐并确保正确格式化BAM文件，为GATK变体调用准备样本（配对末端FASTQ文件）。 MycoSNP GATK变体：调用变体并生成一个多FASTA文件。 该存储库包含MycoSNP BWA参考工作

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    • 发布日期：2021-02-23
    • 文件大小：26624
    • 提供者：weixin_42175035

  1. 基于侧向散射激光雷达的PM2.5浓度测量误差

  2. 根据CCD侧向散射激光雷达(Clidar)及Mie散射理论, 建立侧向散射光强分布与PM2.5浓度的关系模型, 并分析测量误差。在研究过程中, 搭建以波长为532 nm的激光器为光源、CCD为接收器的Clidar PM2.5浓度测量系统装置; 将获取的侧向散射回波信号图与BAM-1020颗粒物监测仪记录的PM2.5浓度进行对比, 建立高、低增益下各等级模型的关系式。将高、低增益各等级模型的PM2.5预测值与实际测量结果进行对比, 得到各模型的平均误差、残差方差和综合偏差率统计量, 并确定最佳反演

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-22
    • 文件大小：3145728
    • 提供者：weixin_38601499

  1. HTSmetadata：内省样本的高吞吐量排序文件集并生成tsv和json数据集-源码

  2. HTS元数据 内省高吞吐量测序（HTS）文件集并生成tsv和json数据集 用法 metadataFromHTSfileOfFiles.py [-h] [-i [I]] [-l [L]] [-t [T]] [-j [J]] 收集由文件定向的元数据数据集，该文件包含hts（bam）文件的路径，每行一个路径。 例子： python metadataFromHTSfileOfFiles.py -i〜/ tmp / paths.txt -t〜/ tmp / test.tsv -j〜/ tmp / js

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-21
    • 文件大小：4096
    • 提供者：weixin_42129113

  1. P5-Snake-Game：建立在P5.js上的Snake游戏-源码

  2. P5蛇游戏 建立在P5.js教程上的Snake游戏如下： : AaGK-fj-BAM t 402s

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-19
    • 文件大小：52224
    • 提供者：weixin_42171132

  1. dfir-源码

  2. 数字取证 SANS DFIR海报 与Syscache配置单元一起玩 BAM内部 恶意软件下载 恶意软件集市 恶意软件分析中心 混合分析 威胁书 恶意软件分析 Powershell测井备忘单 通过PowerShell日志记录提高可视性 解压缩Confuserex 1.0 Max Settings的简单方法 如何解压缩ConfuserEx最简单的方法（最大设置） Mac OS X恶意软件分析 OSINT 令人反感的OSINT s01e01-OSINT和RDP 工具 dnSpy

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-19
    • 文件大小：1024
    • 提供者：weixin_42166261

  1. strview：一个细工具，用于详细说明STR区域周围的读数和参考之间的对齐方式-源码

  2. 视线 一个详细说明STR区域周围阅读和参考之间对齐的小工具 用法：strview.py [-h] [--bam BAM] [--read READ] --ref REF --config CONFIG --output OUTPUT [--parasail PARASAIL] [--pysam PYSAM] [--verbose VERBOSE ] 可选参数：-h，--help显示此帮助消息并退出--bam BAM bam文件--read读取读取的文件--ref REF ref文件--conf

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-19
    • 文件大小：4096
    • 提供者：weixin_42156940

  1. 核苷酸多样性-源码

  2. 核苷酸多样性计算 概述 该程序估计基因组序列的核苷酸多样性。 用法 步骤1-BAM文件转换 使用转换BAM文件。 samtools view -h -G69 to.convert.bam | samtools view -h -G133 > file.bam 对于每个样本，从BAM文件中生成一个strandcount.csv。 java -cp /your-path-to/HAROLD/lib/htsjdk-unspecified-SNAPSHOT.jar: /Your-path-t

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-18
    • 文件大小：31457280
    • 提供者：weixin_42131728

  1. PSI-Sigma：PSI-Sigma-源码

  2. PSI-西格玛 剪接百分比（PSI）值通常用于报告替代性的mRNA剪接（AS）变化。 但是，以前的PSI检测方法仅限于特定类型的AS事件。 PSI-Σ是使用新的剪接指数（PSIΣ）是更加灵活，可以incoporate新颖结，并且可以计算在复杂的剪接事件个体外显子的PSI值。 PSI-Sigma现在已发布： : 更新 最新版本： ： 尝试“-帮助”功能。 在自然界中使用PSI-Sigma的新论文： ： 人类U87细胞纳米Kong长时间读取PCR-cDNA-seq的比对文件： :

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-16
    • 文件大小：433152
    • 提供者：weixin_42141437

  1. 数据处理-源码

  2. 数据处理 对习题2的疑问：DAG并非真正起作用，请使用以下命令：snakemake --dag sorted_reads / {A，B，C} .bam | 点-Tsvg> dag.svg 仍然不是没有水的问题是。

  3. 所属分类：其它

    • 发布日期：2021-02-16
    • 文件大小：23068672
    • 提供者：weixin_42127775
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